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丢弃。强约束条件个数1~3个最佳,不宜过多,过多的强约束会导致输出结果数量少于预期或者没有分子生成。如果设置的官能团结构太大,建议放到弱约束,因为这样设置会使模型可探索的区间比较小,导致可能没有结果生成。如果分子较难优化,优化后的分子数过少,建议可以适当放宽强约束的条件设置,比如相似度可以放宽到0
发布中的应用可以取消,取消后状态为发布失败。 已发布的应用可以订阅和下线。 同一个发布者可以发布同名称,同类型的应用。若版本不同,则合并。用户在使用时,可以选择对应的版本号进行订阅或者下线。若版本相同,则更改版本后发布。 已发布的应用,可以在“资产市场>我的发布”中进行下线。下线后已经订阅的应用不可以使用。
搭建NGS流程 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 流程”页签,单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”,其他参数可选填。参数填写完成后,单击“确定”,完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用,并使用鼠标拖拽至画布中。
对情况的计算评估,让研究人员可以同时从21个蛋白的角度,综合、无偏地评估药物效果,从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果(https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821),并搭建虚拟药物筛选数据库。
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter No
--password -w 是 密码。 --ak -a 是 AK(Access Key ID):访问密钥ID。 --sk -s 是 SK(Secret Access Key):与访问密钥ID结合使用的密钥。 --region -r 是 服务区域名称。 --platform-id -i
--platform-id xxx 表2 参数说明 参数 是否必填 说明 --ak 是 AK(Access Key ID):访问密钥ID。 --sk 是 SK(Secret Access Key):与访问密钥ID结合使用的密钥。AK、SK获取方法请参见步骤1:获取认证信息。 --region 是 服务区
数据管理简介 EIHealth平台使用对象存储服务(OBS)存储原始数据、流程执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分,从项目角度进行数据的管理,不同项目的数据可以通过“导入数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面,“数据”页签中,完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。
创建数据库时,数据库模板为您提供了一个数据表的搭建框架,可通过数据库模板灵活的定义数据结构,描述数据及其关系。数据库以项目为粒度进行资源的隔离和访问控制,不同成员角色对数据库的操作权限请参见成员角色和权限。 预置数据库和模板 平台内置“神农项目”药物虚拟筛选数据库和药物配体注释信息数据
设置用户邮件配置 功能介绍 设置用户邮件配置 URI PUT /v1/{project_id}/messages/email-client-config 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
户为root。 平台提供了必要的加固措施以保证容器安全、隔离性及数据安全,但由于容器技术本身的限制,仍可能存在容器逃逸等问题,进而导致越权访问。 为避免此类问题发生,请您确保上传镜像来源的合法性、有效性,禁止上传未知来源、恶意程序等非法镜像。 父主题: 镜像管理
on current platform. 请检查访问的接口是否支持。 403 eihealth.01000069 The OBS file path {0} is not permitted to access. 请检查是否有权限访问该文件路径。 404 eihealth.01000001
环境升级,应用、流程支持X86、ARM运行,新增消息中心 项目管理:以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 预置流程:预置流程包括NGS、GATK、Cell Ranger和Druglikeness。 项目间资产共享:实现跨项目数据、应用、流程的使用。
pyter Notebooks一样的组件。 打开JupyterLab 选择状态为“运行中”的Notebook实例,单击“操作”列的“打开”访问Notebook。 单击右上角的“Open JupyterLab”,可直接打开此Notebook实例对应的JupyterLab页面。 图1
title String 资产展示名 labels Array of strings 资产标签列表 picture String 资产封面图访问链接 vendor_id String 供应商id versions Array of VersionRsp objects 资产版本号列表
最小长度:1 最大长度:128 user_id 是 String 用户id 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token
对于“JOB_STATUS”类型的消息,可单击图标,跳转至对应的分析作业详情页面。您可以在该页面查看详细的运行信息。 消息通知按照用户权限进行划分,只可以查看有权限访问的项目中的消息通知。 父主题: 系统设置
String 作业子任务的并发实例运行结束时间 actual_running_time Integer 作业子任务的并发实例实际运行时间 status String 作业子任务的并发实例运行状态 log_storage_link String 作业日志存储链接 pod_create_time
作业的名称。 通过流程ID(workflow id)启动作业时,必选。 --io-acc-id -c 否 IO加速实例id,为空则不开启IO加速,设置相应加速包id将会开启加速。实例id可参考“系统设置命令>获取系统资源”章节获取。当id设置为:auto_schedule,则会自动调度加
性能加速资源列表 表4 PerformanceResourceRsp 参数 参数类型 描述 id String 实例ID resource_id String 资源ID name String 实例名称 spec SpecDto object 规格信息 availability_zone_id String