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预计结束时间，毫秒。 表6 ReceptorDrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url
多个子结构之间的逻辑关系 缺省值：or 枚举值： or and 表9 BindingSite 参数 参数类型 描述 protein String 蛋白质3D结构，使用gzip压缩然后转base64格式 最小长度：1 最大长度：10000000 bounding_box BoundingBox object
url获取方法 在Notebook列表页面，按F12键打开，切换至Network页签。 单击页面右侧按钮，在Network页签的“Name”列单击“notebooks?offset=0&limit=10”，右侧展开代码行，在“url”行获取url链接，如下图所示。 图1 获取url
购买CSS资源 登录CSS云搜索服务。 单击“创建集群”。 图1 创建集群 基础配置：选择“计费模式”、“当前区域”。 集群类型选择“Elasticsearch”，输入集群名称。 图2 基础配置 节点规格：参考自己的数据库大小。自定义数据库所需要的的CSS节点规格大于“4 vCPUs
JupyterLab简介及常用操作 JupyterLab是一个交互式的开发环境，是Jupyter Notebook的下一代产品，可以使用它编写Notebook、操作终端、编辑MarkDown文本、打开交互模式、查看csv文件及图片等功能。 可以说，JupyterLab是开发者们下
名称”中修改模板名称，单击“确定”。 图1 从其他项目导入模板 平台也提供了yaml格式的数据库模板，您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用，数据库模板支持yaml或yml格式，且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”，单击“下载示例文件”下载数据库模板示例，编辑后上传模板文件至平台，单击“确定”。
创建应用 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 应用”页签，单击“新建应用”。 图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据，如果需要批量执行NGS分析，可以选取以下任意一种方式进行批量执行： 方式一
中的文件或文件夹。 文件或文件夹删除完成后，需单击右上角的刷新按钮刷新页面，清除缓存文件。 图4 删除 使用Notebook Terminal功能 对于习惯编码的开发者可以使用Terminal功能进行开发、调试和运行分析任务。 在“Files”页签下，单击右上角“Open Jup
是否必选 参数类型 描述 smiles 是 String 分子SMILES表达式 databases 是 Array of strings 搜索使用到的数据库集合 top_n 否 Integer 期望最大返回条目数（排序后取Top） 最小值：1 最大值：1000 响应参数 无 请求示例
新建研究 进入“专题”页面，单击“新建研究”。 图1 新建研究 参考表1，设置运行信息。 表1 参数说明 参数 说明 选择项目 选择创建好，并带有数据的项目。 研究名称 可自定义研究名称。 流程 选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。 配体分子 选择上传的配体小分子文件。
编辑应用 您可以对已经创建的应用进行编辑，修改对应参数信息。 在应用列表页面，选择需要修改的应用，单击操作列“编辑”。 图1 编辑应用 在编辑应用页面，可以修改相关的参数。相关参数描述可参考新建应用。 如果更改了版本号，相当于新建一个应用。 父主题： 工具管理
目。 例如，使用health switch project ngs-project命令进入到名为ngs-project的项目中。 使用命令行工具，用mkdir命令创建存储数据的文件夹。 例如，使用health mkdir input-data命令创建名为input-data的文件夹。
下载命令行工具 使用win键+R，输入cmd打开windows的cmd窗口。进入工具所在的目录，输入health命令，即可使用。 如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录，请使用cd命令切换路径。例如，切换至D盘： cd /d d: 图2 客户端 使用Linux版本命令
数据管理简介 盘古辅助制药平台使用对象存储服务（OBS）存储原始数据、作业执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分，从项目角度进行数据的管理，不同项目的数据可以通过“复制数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面，“数据”页签中，完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。
装的流程写成DockerFile，使用Docker build构建成Docker镜像。 快照方式制作镜像 如果后续镜像没有变化，可通过快照方式制作镜像。 快照方式制作镜像示例： 本示例中使用华为云弹性云服务器服务（ECS）创建一台云服务器，并使用快照方式制作bwa镜像。 购买弹性云服务器。
效。 删除：运行中的任务不支持删除，只可删除运行结束的数据。 重试：可对执行失败的任务从失败位置进行重试。 复制数据 在“数据中心”页面，使用“复制”，将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击页面右上角“复制”。 图1 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹，以及数据存储路径，单击“确认”，复制数据。
导入用户 盘古辅助制药平台支持把IAM子用户导入至平台子用户。通过导入已有子用户，增加用户使用的便捷度，方便用户维护账号。 使用管理员账户登录盘古辅助制药平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 在用户管理页面，单击“导入用户”，进入“导入用户”页面。 在导入用户页面，可以选择“用户”或者“用户组”进行导入。
缺省值：or 枚举值： or and 表6 BindingSite 参数 是否必选 参数类型 描述 protein 否 String 蛋白质3D结构，使用gzip压缩然后转base64格式 最小长度：1 最大长度：10000000 bounding_box 否 BoundingBox object
靶点发现 靶点口袋发现 靶点优化 父主题： 功能模块
自定义属性任务（MCP） 新建自定义属性任务接口 查询自定义属性任务 父主题： API（AI辅助药物设计）
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