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本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果(https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821),并搭建虚拟药物筛选数据库。 图1 药物筛选之旅 父主题: 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选
载同一类业务或只面向特定租户提供业务服务的专用Region。 可用区(AZ,Availability Zone) 一个AZ是一个或多个物理数据中心的集合,有独立的风火水电,AZ内逻辑上再将计算、网络、存储等资源划分成多个集群。一个Region中的多个AZ间通过高速光纤相连,以满足用户跨AZ构建高可用性系统的需求。
描述 method 是 String 聚类方法,当前仅支持hiq_mc。 最小长度:1 最大长度:20 file 是 String 分子聚类源数据。 最小长度:1 最大长度:2000 output_dir 是 String 分子聚类输出结果。 最小长度:1 最大长度:1200 响应参数
用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置,可创建平台的子用户,并为其分配权限。 项目级别用户管理 资源级的角色配置,以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组,以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。详细介绍请参见项目管理,项目级用户不同角色对应的权限请参考成员角色和权限。
上传镜像到SWR镜像仓库 上传镜像前,您需要安装容器引擎并完成镜像的制作,详细操作请参考安装容器引擎、制作Docker镜像。如果您已经安装了容器引擎,请跳过该步骤。 下载命令行工具并进行初始化配置。 使用health switch project命令进入到所需的项目中。 # 命令结构
能开始搜索。默认值30min,取值范围5-60。 每个产物最大反应数量:合成路径中每一个中间产物最多有多少种可能的反应,按照反应置信度从高到低排序。最大反应数量增加,每个中间产物的可搜索反应范围数量增加,作业运行时间延长;最大反应数量减少,可能会有部分合理反应未能纳入搜索。默认20,取值范围2-20。
规格信息 system_disk DiskDto object 系统盘 data_disks Array of DiskDto objects 数据盘 image ImageDto object 系统镜像 charge_mode String 计费模式 create_time String
TaskInstanceStatusRsp object 实例状态信息 metadata TaskInstanceMetadataRsp object 实例元数据信息 spec TaskInstanceSpecRsp object 实例cpu和内存使用率信息 表6 TaskInstanceStatusRsp
delete_time String 请求删除时间 is_core Boolean 是否为核心项目 storage_quota Long 项目数据容量配额,-1表示无容量限制 表4 ProjectRoleRsp 参数 参数类型 描述 role_type String 项目角色名 users
最小长度:1 最大长度:512 formula String 配体分子的化学式。 最小长度:1 最大长度:128 is_3d Boolean 标识原始数据是否为3D。 structure LigandStructureDto object 配体3D结构。 reason String 解析失败的理由。
GenerationResultItem objects 分子生成结果条目 initial_dataset_size Integer 初始化数据集的分子条目数 strong_constraints Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints
String 自动作业创建时间 finish_time String 自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID database_column String 自动作业状态更新列 database_column_type String 自动作业