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#列出当前project的job的基本信息 #表示取3条数据,也就是取1-3 条数据 health get job -o 10 同 health get job -l 100 -o 10 #列出当前project的job的基本信息 #表示取100条数据,也就是取11-110 100 条数据 health get
描述 source 是 String 受体的数据源:用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为用户私有数据中心为项目路径,为公共数据场景时为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000
PAINS: 频繁命中化合物过滤,PAINS数据库具有480个子结构。 结果解释:数值代表有多少个子结构匹配该数据库,可以通过DETAIL查看所匹配的子结构特征。 ALARM NMR Rule: 频繁命中化合物过滤,ALARM NMR数据库具有75个子结构。 结果解释:同PAINS。
API(医疗智能体平台) 项目管理 系统管理 数据管理 数据库管理 应用管理 资产市场 notebook开发环境 Nextflow接口
、创建者、修改时间、创建时间、源项目进行排序。并可执行查询、修改和删除应用的操作。 图1 应用列表 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。流程通过流程设计器创建,创建好的流程将存储于“项目管理”页面“工具”页签中。在该页签中,以列表形式展示了项目中的流
是否必选 参数类型 描述 source 是 String 文件来源,支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度:1 最大长度:8 url 否 String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String
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最大长度:128 template_id 否 String 数据库模板id 最小长度:1 最大长度:128 database_name 是 String 数据库名称 最小长度:3 最大长度:32 relative_path 是 String 生成数据库实例的文件相对路径 最小长度:0 最大长度:1024
文件来源,支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度:1 最大长度:8 url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。
如何在Notebook中安装外部库 在Jupyter Notebook中安装 例如,通过Jupyter Notebook在“TensorFlow-1.8”的环境中安装Shapely。 打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中,选择“New”(新建),然后选择“TensorFlow-1
设置内存大小。 取值范围:2~512,默认为2。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 包含本项目桶最多挂载6个,不包含本项目桶最多挂载5个。 用户在Notebook列
基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后,在医疗智能体平台搭建NGS流程,执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能,通过获取示例数据,创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
描述 --code -s 是 计算节点规格。 --data-disk-spec-code -d 否 额外数据盘规格。 --extra-data-disk-size -e 否 额外数据盘大小。 单位:G。 默认值:100。 --zone -z 是 可用区id。如:cn-north-7c。
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题: 系统管理
Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 Mapping and Sort and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 Insert Size Estimation 针对构建Index后的bam文件,统计测序数据的Insert size的分布。
String 模型数据文件来源。 枚举值: public private url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id String 模型文件所在项目id,仅文件为数据中心时填写。
购买计算资源(主账号操作) 计算资源说明 资源看板 计算资源 存储资源 性能加速(可选) 数据库(可选)
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载同一类业务或只面向特定租户提供业务服务的专用Region。 可用区(AZ,Availability Zone) 一个AZ是一个或多个物理数据中心的集合,有独立的风火水电,AZ内逻辑上再将计算、网络、存储等资源划分成多个集群。一个Region中的多个AZ间通过高速光纤相连,以满足用户跨AZ构建高可用性系统的需求。
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