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靶点口袋发现 靶点口袋发现实现全新元动力学算法,高效遍历柔性蛋白表面,找到潜在口袋位置。 单击“靶点口袋发现”功能卡片,进入配置页面。 在配置页面,选择靶点文件、探针文件,配置相关参数信息。 靶点文件:支持PDB格式文件。 探针文件:探针分子建议原子数不超过400,分子量过大可以
如何在Notebook中安装外部库 在Jupyter Notebook中安装 例如,通过Jupyter Notebook在“TensorFlow-1.8”的环境中安装Shapely。 打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中,选择“New”(新建),然后选择“TensorFlow-1
数组长度:3 - 3 padding 是 Float 口袋的padding值。 最小值:0 最大值:20 响应参数 无 请求示例 设置口袋中心位置、大小和padding的值生成可渲染的口袋文件内容。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug-common/toolkit/pocket
一个AZ是一个或多个物理数据中心的集合,有独立的风火水电,AZ内逻辑上再将计算、网络、存储等资源划分成多个集群。一个Region中的多个AZ间通过高速光纤相连,以满足用户跨AZ构建高可用性系统的需求。 项目 华为云的区域默认对应一个项目,这个项目由系统预置,用来隔离物理区域间的资源(计
行信息:输入输出,节点参数,应用以及日志等信息。 单击具体的输出参数便可跳转到具体的文件位置。 图14 查看应用信息 图15 查看输入、输出数据位置 单击输出参数路径,可以跳转至输出文件位置。 图16 获取输出数据 父主题: 运行作业
查询系统配置列表 功能介绍 获取系统配置列表 URI GET /v1/{project_id}/system/configs 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。 将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平台的镜像管理,实现高效的调用,极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜
月。 单击“下一步”,确认订单详情。 单击“立即购买”,并支付订单,完成服务购买。 购买成功后,需要大约30分钟时间完成服务自动部署,请耐心等待。部署完成后,您可以使用注册的华为账号使用医疗智能体平台。 父主题: 准备工作
er”。 选择安装位置,按“Enter”。 安装完成后,输入“yes”。 初始化Anaconda配置并测试安装。 执行以下命令初始化Anaconda配置。 export PATH=~/anaconda3/bin:$PATH source ~/.bashrc 测试安装。 conda
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ReceptorDrugFile object 受体文件。 bounding_box 是 BoundingBoxDto object 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 remove_ion 否 Boolean 去除受体中的离子。 缺省值:true remove_water 否 Boolean
件”。 配置受体口袋位置,如果包含多个受体文件,需要每个受体都进行口袋设置,才能单击提交。 原始配体 将原始配体作为口袋位置,也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。 选择残基 选择某些残基来作为口袋位置。 自动预测 如果受体口袋位置未知,可以使用自动预测软件来进行口袋位置预测。 全局对接
cpu_detail String CPU物理规格描述信息 disk_detail String 磁盘物理规格描述信息 memory_detail String 内存物理规格描述信息 netcard_detail String 网卡物理规格描述信息 cpu_arch String
将原始配体作为口袋位置,也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。 选择残基 选择某些残基来作为口袋位置。 自动预测 如果没有受体口袋位置未知,可以使用自动预测软件来进行口袋位置预测。 全局对接 将整个受体作为口袋位置。 自定义 手动修改口袋位置和大小。 padding 口袋位置放大多少尺寸。
上传镜像到SWR镜像仓库 上传镜像前,您需要安装容器引擎并完成镜像的制作,详细操作请参考安装容器引擎、制作Docker镜像。如果您已经安装了容器引擎,请跳过该步骤。 下载命令行工具并进行初始化配置。 使用health switch project命令进入到所需的项目中。 # 命令结构
将原始配体作为口袋位置,也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。 选择残基 选择某些残基来作为口袋位置。 自动预测 如果没有受体口袋位置未知,可以使用自动预测软件来进行口袋位置预测。 全局对接 将整个受体作为口袋位置。 自定义 手动修改口袋位置和大小。 padding 口袋位置放大多少尺寸。
区域是一个地理区域的概念,由于带宽原因,会在多个地区建立数据中心,提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四,区域名称为cn-north-4;部署在华东-上海一,区域名称为cn-east-3。 获取平台ID 平台ID与“命令行工具 > 步骤3 初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。
区域是一个地理区域的概念,由于带宽原因,会在多个地区建立数据中心,提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四,区域名称为cn-north-4;部署在华东-上海一,区域名称为cn-east-3。 获取平台ID 平台ID与“命令行工具 > 初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。 在右
区域是一个地理区域的概念,由于带宽原因,会在多个地区建立数据中心,提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四,区域名称为cn-north-4;部署在华东-上海一,区域名称为cn-east-3。 获取平台ID 平台ID与“命令行工具 > 步骤3 初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。
要导出的id列表文件,使用job-id文件导出作业时必选。 job-id-file 无 否 要导出的id列表的文件位置。 文件内容格式:{"ids":"id1;id2;id3"}。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-to