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com/v1/{project_id}/nextflow/engines { "version" : "1.0.0" } 安装Nextflow，上传本地名为test.txt的Nextflow文件 { "total_part" : 1, "part_number" : 1, "file_name"
获取应用模板 使用health get app -s命令获取创建应用的模板，复制模板并保存到本地，您可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。模板修改好后，再使用命令行工具上传模板，创建应用。
因组DNA, 进行高通量测序分析，或克隆DNA到合适的载体，导入宿主菌体，筛选目的转化子等工作。 该流程主要基于Kraken2构建，跟进数据库进行物种注释。 RNA Cufflinks transcriptome analysis process 二代基因组测序即Next Generation
为源项目名称，可选。不指定srcproject时，默认为当前项目。例如GATK:4.0:projectname。 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。 --summary -s 否 应用的简要描述。 --description -d 否 应用的详细描述。 --commands
alth所在目录。 cd /home/user-name/test/client/ 图3 客户端 使用Linux版本命令行工具时，您需要在本地搭建Linux环境，并将下载的health文件放至所需的目录下。macOS执行命令和linux一致， 如果当前目录为health所在目录，可以使用
图3获取路径。 cd /d d:\demo 图2 cmd窗口输入health命令 图3 获取路径 使用Linux版本命令行工具时，您需要在本地搭建Linux环境，并将下载的health文件放至所需的目录下。macOS执行命令和linux一致， 如果当前目录为health所在目录，可以使用
文件创建成功后，将直接呈现Console页面。 图6 新建文件（Console） 上传文件 进入JupyterLab页面后，您可以单击左上角“Upload”快捷键，从本地选择一个文件上传。 图7 上传文件 编辑文件 JupyterLab可以在同一个窗口同时打开几个Notebook或文件（如HTML、TXT、Markdown等），以页签形式展示。
模型推理参数，预留参数接口，给需要调用的自部署模型用 # 请注意：您调用的第三方大模型API服务，其数据传输及处理可能涉及第三方服务器。本应用及平台不对第三方服务的内容、准确性、完整性及安全性承担任何责任。 # 请勿在使用过程中输入敏感、个人隐私或机密信息。使用本
解除引用 下载数据 下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 展开数据文件夹，选择待下载的数据。 单击“操作”列“下载”。 单击鼠标右键，选择“链接另存为”，下载数据。
Calling，输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过VariantQC对vcf进行质量控制，输出变异数目，变异类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速。流
获取作业事件或者作业某一task事件，单独使用表示获取作业事件；与--task一起使用表示获取某一个task事件，并同时输出task实例列表。 --log -g 否 本地存放task日志的路径，必须与--task一起使用以获取作业某一task的日志。 --task -a 否 task名称。如果是并发的tas
"workflow" }, "database_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "database_name" : "demo-database" } ], "count" : 1 } 状态码
-o history命令恢复。 清理命令记录 为防止配置文件中的敏感信息泄露，建议使用health config clear命令定时清除本地配置文件。 对于执行的历史命令，可通过以下方法清除。 Linux：执行history -c命令清除历史记录，重新登录命令行工具后，记录可恢复。执行rm
CANCELLED lmx-test-01 2021-02-01 11:11:27 lmx-database-01 data DATABASE_IMPORT xxx PROCESSING lmx-test-01 2021-02-01
应用场景 基因组分析 提供从基因组数据管理、生物信息分析流程到科研分析管理整个流程的服务，快速实现基因组数据分析及AI建模，提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持，让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一，基
约束与限制 使用区域限制 医疗智能体目前支持的区域为“华北-北京四”、“华东-上海一”、华南-广州。 盘古辅助制药平台仅在“华东-上海一”支持。 不同区域云服务产品之间内网互不相通；请就近选择靠近您业务的区域，可减少网络延迟，提高访问速度。 平台用户权限限制 EIHealth平台
式（此时Cell中有光标，可以进行代码编写）。在命令模式下，按下“Enter”键或者鼠标单击代码框可以进入编辑模式。在编辑模式下，按下“ESC”键或者鼠标单击代码框左侧区域即可进入命令模式。 删除文件或文件夹 如果需要在Notebook中删除文件或文件夹，您可以在“Files”列
关键概念 镜像 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平
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