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Spectrum MPI。 将1.a中下载的MPI软件包上传至运行MPI的BMS内(建议“/home/rhel”目录下)。 执行以下命令,设置环境变量。 如果选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export IBM_SPECTRUM_MP
env 本例中执行sed -i 's/0x[a-f0-9]*/0xf05/g' ucx.env 图4 替换ucx中的PKEY 将ucx pkey设置为环境变量。 # sed -i 's/^UCX/export UCX/g' ucx.env # cat ucx.env >> ~/.bashrc
拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。设置每迭代100步生成一个checkpoint文件,假定该文件存放在共享目录“/share”中。内容如下: # 3d Lennard-Jones