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执行以下命令,给密钥文件配置权限。 $ sudo chmod 600 id_rsa 执行以下命令,ssh方式登录本节点,验证是否可以不输入密码登录BMS。 $ ssh localhost 图1 免密登录BMS 系统回显结果如图1所示,可以无密钥登录本节点,表示权限配置成功。 依次登录集群中其他BMS,重复执行步骤1~5。
按照提示输入Enter或1(accept the agreement)直到安装完成,以下为安装成功界面。 图1 Platform MPI安装成功 默认安装路径为/opt/ibm/platform_mpi。 配置MPI环境变量。 执行以下命令,获取pkey。 # cat /sys/c
安装和使用MPI(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform
据Mellanox提供的操作指导进行安装。 以操作系统CentOS 7.3为例,推荐安装4.2.1版本的安装包,下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0.0-rhel7.3-x86_64.tgz”,并执行以下命令进行安装: # yum install tk tcl
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 该任务指导用户在鲲鹏BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(以版本4.0.2a1为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。
处理方法 检查“/etc/ssh/sshd_config”配置文件,确保配置文件中“AuthorizedKeysFile”添加了“/usr/local/.hpccluster/role/.ssh/authorized_keys”配置项。 检查“/usr/local/.hpccluster/role/
社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI
HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI MPICH 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景)
社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(X86 BMS场景)
所在区域、虚拟私有云、安全组、节点信息以及共享存储以及集群的关系图等信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群,单击集群名称查看集群详情页。 在集群的详情页面可查看集群ID、状态、所在区域、虚拟私有云、安全组、节点信息以及共享存储以及集群的关系图等信息。
该任务指导用户在BMS集群上运行Intel MPI应用(l_mpi_2017.3.196版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行Spectrum MPI应用(10.01.01版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
form MPI应用(platform_mpi- 09.01.04.03r-ce.bin版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Platform MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 #
在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景) 该任务指导以CentOS 7.6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
IB网口配置为connected模式。 当前版本的网卡驱动不支持connected模式。 由于网卡驱动性能原因,系统关闭了connected模式,因此,当前版本网卡驱动不支持配置connected模式。 IPoIB的IP地址分配方式有哪些 有两种IP地址分配方式:静态配置和DHCP动态配置。
简介 图解HPC解决方案 HPC简介 HPC和公有云 IPoIB功能简介 配额调整
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(3.1.0rc2版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++ wget http://www.fftw
裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI(X86 BMS场景) 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)