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分子优化 分子优化基于盘古药物分子大模型，以参考化合物为起点，针对给定的期望理化性质，得到性质更优、结构新颖、与靶点蛋白亲和力高的化合物。 单击“立即使用”，进入输入分子页面。 图1 输入分子页面 在白框内输入需要优化的小分子SMILES表达式或者上传分子文件。 上传的文件支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式。
rity结合起来使用，可以很好的将流程在不同平台之间进行迁移，并且能够保证结果的可重复性。Nextflow最大的优点是它是基于数据流的程序模型，因此不用自己去写复杂的并行化的程序，只需要关注“数据流”即可。流程中的每个process可以通过配置文件快速的定制并行执行的样本数目，大
子量作为强约束对分子设计过程进行限制，不合适的分子量范围可能会导致没有结果输出。 选择属性模型：选择AI模型。如果需要创建模型，可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。 名称：可修改，修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符；仅可以使用字母、数字、
欢迎使用盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台是以盘古药物大模型为基础打造的一站式药研平台，助力药物研发效率提升60%+。平台提供靶点发现，苗头化合物发现，先导化合物优化全流程药研所需功能。同时基于云原生的软硬件一体化加速，大大提升虚拟筛选和分子动力学模拟计算效率。 全平台无需软硬件
BasicDrugModel 参数 参数类型 描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object
是通过设置分子骨架搜索具有相同骨架的分子。 选择数据库：最多可选择10个数据库。 选择属性模型：选择AI模型。如果需要创建模型，可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。 输出个数：输出个数越多，任务时间越长。 作业名称：设置作业名称。长度为5~64个字
基础版与专业版区别 功能配额 专业版 基础版 用户总数 50 10 项目总数 100 50 单用户创建项目数 20 20 作业并发数 150 30 模型训练&模型管理 支持 不支持 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
【必需】 # 配合GenomeAgent(model='fromconfig')使用，配置模型的模型推理参数，预留参数接口，给需要调用的自部署模型用 # 请注意：您调用的第三方大模型API服务，其数据传输及处理可能涉及第三方服务器。本应用及平台不对第三方服务的内容、准确性、完整性及安全性承担任何责任。
BasicDrugModel 参数 参数类型 描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object
BasicDrugModel 参数 参数类型 描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object
BasicDrugModel 参数 参数类型 描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object
ValueRange object 属性欠佳值域区间 style 否 String 模型参数呈现类型 枚举值： number probability confidential_interval 否 Boolean 模型推理是否呈现置信区间 表6 ValueRange 参数 是否必选 参数类型
BasicDrugModel 参数 参数类型 描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object
用户指南（盘古辅助制药） 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 收藏夹 相关参数
靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI作业管理 靶点优化作业管理 聚类分析作业管理 药物模型管理
ValueRange object 属性欠佳值域区间 style String 模型参数呈现类型 枚举值： number probability confidential_interval Boolean 模型推理是否呈现置信区间 表9 ValueRange 参数 参数类型 描述 lower
数组长度：0 - 5 base_model_id 否 String 基模型id。 缺省值：pangu-drug-model 最小长度：0 最大长度：128 model_ids 否 Array of strings 模型id列表。 最小长度：1 最大长度：128 数组长度：0 - 10
最大值：1 缺省值：0.6 base_model_id 否 String 基模型id。 缺省值：pangu-drug-model 最小长度：0 最大长度：128 model_ids 否 Array of strings 模型id列表。 最小长度：1 最大长度：128 数组长度：0 - 10
ValueRange object 属性欠佳值域区间 style 否 String 模型参数呈现类型 枚举值： number probability confidential_interval 否 Boolean 模型推理是否呈现置信区间 表6 ValueRange 参数 是否必选 参数类型
ValueRange object 属性欠佳值域区间 style String 模型参数呈现类型 枚举值： number probability confidential_interval Boolean 模型推理是否呈现置信区间 表7 ValueRange 参数 参数类型 描述 lower
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