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已取消:取消已提交或者运行中的作业。已取消的作业允许重试、删除、克隆。 查看作业详情 您可以通过单击作业名称,进入详情页面,查看详细的运行信息。包括状态、标签、描述、创建时间、完成时间、总耗时等。 对于执行失败的作业,鼠标点击作业状态,在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。
通用工具 > 聚类分析”功能卡片,进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式:选择文件和手动输入类型。 上传分子文件:选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件;文件大小不超过5G;小分子支持10-10,000个,超出10,000的分子会进行截断。 输入小分子:可以通过上传文件或输入SMILES以输入小分子。
vcf文件生成数据库。创建的数据库需要保证数据文件与模板对应。创建数据库时,可以不选择导入的数据文件,建立空的数据库,后期可以新增数据行或者导入数据。如果使用自动作业的数据表创建数据库,在导入数据,需要参照数据库模板格式进行导入。 您可以导入本项目或使用其他项目中的数据生成数据库。 选
传至对应的OBS路径下。 包含本项目桶最多挂载6个,不包含本项目桶最多挂载5个。 用户在Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作。 参数填写无误后,单击“立即创建”,创建Notebook。 步骤3:预览AutoGenome案例 打开创建的Notebook。
创建项目 新用户进入平台后需要自己创建项目,单击“创建项目”按钮,填写项目名称以及选择对应的数据保护策略,数据保护策略参考下面配置。 图1 创建项目 单击项目名称可进入到对应的项目中。 图2 进入项目
取的结合能信息均公开在“神农项目”中。 图1 “神农项目”药物虚拟筛选数据库 图2 数据库模板 药物配体注释信息数据库 数据库呈现了“神农项目”中8500多种药物的注释信息。包含了药物在DrugBank数据库中的ID、药物通用名称、分类、化学式、SMILES结构式、标签和成药性相关的信息。
使用“导入应用”功能,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入应用”,进入导入应用页面。 图1 导入应用 选择需要引用的项目以及项目中的应用,选择应用的版本。“导入应用名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。 图2 导入应用 单击“确定”,导入应
(IAM账号)。 在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签,则说明是子账号;没有“我的主账号”页签,则说明是主账号。 图1 查看账号信息 购买服务 医疗智能体平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择。 关于计费模式的详细介绍,请参见计费说明。 登录华为云管理控制台,在左侧服务列表中选择“人工智能
用户可以在“项目 > 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”,获取输出结果的路径。 文件的命名方式为:蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2 下载小分子构想数据 父主题: 运行大规模虚拟药筛任务
在平台右上角用户名中选择“个人设置”,在页面最下方可以查看个人资源配额。 图1 个人资源配额 个人资源配额设置方法 登录系统管理员账号,在平台右上角用户名中选择“用户管理”,进入用户管理页面。在用户名最右侧的操作列,单击“配额设置”。 图2 配额设置 在“配额设置”页面,开启“用户资源配额”开关
照数据库模板值进行填写。 对于空的数据库,编辑时,只允许新增行。 图1 编辑数据 修改完成后,单击“保存”。 删除 数据库创建完成后,单击数据库名称进入数据库详情页,在页面左上角单击“编辑”按钮。 在需要删除的数据行的操作列单击“删除”。 图2 删除数据 在删除弹窗中,单击“确定”。
选择“成员管理”,单击“添加成员”。 图1 添加成员 选择已添加至平台的成员名称及权限。 图2 选择成员 单击“确定”,将用户添加至项目中。 移除、修改项目成员 单击项目名称后面,进入项目设置页。 选择“成员管理”,在“权限”列重新设置项目成员角色。 详细项目成员角色和权限介绍请参见成员角色和权限。 图3 移除、修改项目成员
管理作业 在“作业中心”页签,您可以查看已创建的作业。在操作列,您可以对已创建的作业执行克隆、删除操作。支持对等待中的作业进行取消操作,取消后作业不计费,运行中的作业不能取消。 删除单个作业 选择需要删除的作业,单击“操作”列“删除”即可。 图1 删除单个作业 批量删除作业 一次选中多
数据归档配置 设置平台数据归档的区域。 在账号下面选择“系统设置”。 图1 选择系统设置 进入系统设置页面,设置数据归档配置区域。 图2 配置数据归档区域 父主题: 系统设置
单击计算资源页面,列表中会显示已购买的计算资源,以及是否可用等信息,若新购买的账号则列表为空。 图1 计算资源 单击“购买计算资源”按钮购买计算资源。可以根据业务需要选择不同的资源类型,其中可用区可以选择任意可用区即可。并支持包年包月购买,或者按需购买。 图2 购买计算资源 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
OBS存储类型的Notebook Notebook列表中所有文件的读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作,即Notebook中的数据和被挂载的OBS路径中的数据是同步的。在OBS路径中创建文件夹、上传数据,会同步到Notebook中,Notebook中的操作也会同步到OBS中,如图
传配体。 图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”,配置靶点优化配置参数。 MD引擎:仅支持GROMACS。 时间步长:MD模拟的时间步长,范围支持0<时间步长≤5fs,默认是2fs。 温度:MD模拟的温度,范围支持0<温度≤1000K,默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy
功能调用次数:合成路径规划目前是一个运行成功得作业消耗一次功能调用次数。 图1 分子合成路径 引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果,输出结果缩略图。 图2 查看运行结果(1) 单击查看路径,查看输出结果详情。
导入流程是将隶属于其他项目中流程导入至本项目中,流程所依托的应用和镜像会同步导入。 使用“导入流程”功能,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入流程”,进入导入流程页面。 图1 导入流程 选择需要引用的项目以及项目中的流程,选择流程的版本。“导入流程名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。
Chrome浏览器。 图2 服务列表 进入医疗智能体“总览”页面,单击“购买平台”。 图3 购买平台 购买盘古辅助制药平台。 图4 购买盘古辅助制药 区域:请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。不同区域云服务产品之间内网互不相通。 平台规格:选择“盘古辅助制药平台”基础版或者专业版。