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参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --workflow -w 是 本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。 --name -n 是 流程名称。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表。以","分隔,如:"a
参数 简写 是否必选 说明 instance-name 无 是 数据库实例名称。 --description -d 否 描述。 --template-id -t 是 模板id。 --skip-lines -s 否 跳过的header行数。不指定参数值时默认为0。 --delimiter
MOL Editor Mol Editor工具可以查看小分子的2D结构,以及编辑分子结构。 单击“功能模块 > 通用工具 > MOL Editor”,进入Mol Editor页面即可操作。可以通过单击右上角的“保存”,将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题:
参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 流程id。 --workflow -w 否 本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表,用","分割,如"a,b,c"。
AutoGenome示例 示例名称 说明 single_cell_rfcn_densenet.ipynb 基于RFCN-DenseNet和表达谱对单细胞发育时期进行分类。 pbmc_res_vae.ipynb 基于Res-VAE和表达谱对单细胞数据降维。 步骤4:使用AutoGenome
0个。 查看模型列表 在AI模型页签下支持查看创建的所有模型。包括模型的名称、模型类型、基模型来源、创建时间、完成时间、创建者、状态、组织共享、操作等信息。 图2 查看属性模型列表 查看模型指标 查看loss值:loss代表模型训练的损失变化。 单击相应模型操作列的“查看loss”即可查看相应的训练集Loss。
用户的资源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”,查看配额。 图1 配额管理 父主题: 用户指南(基因平台)
3. 搭建流程 4. 执行分析作业 常见问题 了解更多常见问题、案例和解决方案 热门案例 AK/SK是什么?如何获取AK/SK 如何搭建Docker环境? 如何制作镜像? 如何将生物信息学软件封装为镜像? 更多 远程登录 应用容器化改造介绍 应用容器化改造流程 步骤1:对应用进行分析
项目详情提供了项目中数据大小、成员、创建时间等信息,您可以通过以下两种方式查看项目信息。 查看项目概览 单击项目名称左侧图标,或双击项目行中的空白处,展开项目概览页面。您可以在该页面查看项目的描述、标签、创建时间、更新时间、是否核心项目、数据大小和成员信息。 图3 项目概览 查看项目详细信息 单击项目名称,进入项目“
custom-props { "name" : "my_custom_prop", "description" : "my_custom_prop_description", "type" : "binary", "smiles" : [ "c1ccccc1",
{eihealth_project_id}/jobs { "name" : "demo-job", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "priority" : 0,
镜像名称。 tag-name 无 是 镜像tag名称。 --description -d 否 描述。 --type -t 否 镜像类型,可选APP、NOTEBOOK或OTHER,不填写默认为OTHER。 --chip -c 否 芯片类型,只支持X86和ARM。 --project 无
"custom_prop_name", "type" : "numerical", "description" : "custom_prop_description" } } ] } 响应示例 状态码: 200 ADMET成功响应 { "custom_props"
“工具”页签中,以列表形式展示了项目中的应用。您可以新建应用、导入应用或上传应用,并查看应用详情、版本、创建者、修改和创建时间,可以对名称、创建者、修改时间、创建时间、源项目进行排序。并可执行查询、修改和删除应用的操作。 图1 应用列表 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据
Product-likeness score,天然产物的相似度评分。 结果解释:最佳在-5~5之间,分数越高代表越接近天然产物。 Lipinski Rule: Lipinski规则,MW≤500;logP≤5; nHA≤10; nHD≤5。 结果解释:超过2个及以上不满足以上规则,代表吸收和渗透性较差。
作业执行失败排查思路 启动作业后作业一直处于已提交的状态 问题现象 作业投递后一直处于已提交的状态。 问题排查和解决方案 查看execution log, 若execution log为空,请提交工单或联系服务技术支持。 execution log 提示K8S pod can‘t
平台通过云审计服务(CTS)提供操作记录的收集、存储和查询,审计操作可以设置导出用户的写操作(默认)和读操作(可选),保存周期可以设置需要保存的审计日志的保存周期,下载按钮可以下载最近7天内最新的1万条数据审计日志,查看按钮可以查看及下载保存的审计日志。 通过审计日志可用于支撑安全分
ns/{version} { "summary" : "this is summary", "description" : "this is description", "picture" : "data:image/png;base64,xxxxx", "labels"
查询存储资源 功能介绍 查询存储资源 URI GET /v1/{project_id}/system/storage-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health