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裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI(X86 BMS场景) 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
执行以下命令,查询主机名。 # hostname 执行以下命令,添加本主机私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 示例: 192.168.0.1 ecs-ff-0001 执行以下命令,ssh方式登录本节点,验证是否可以不输入密码登录ECS。 假设本主机的主机名为hostname1,则命令行如下:
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 该任务指导用户在鲲鹏BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(以版本4.0.2a1为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。
3eval_170901-rh7_Apr11.x86_64.rpm 下载需要的HPC-X工具套件。 IBM MPI在EDR SR-IOV场景下的运行需要HPC-X提供的MXM库的支持,HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本,例如,下载的HPC-X版本为:hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4
此时,pbs作业回到queued状态,等待可用的计算资源。 开机2中关闭的计算节点,提供可用的计算资源。 此时,pbs作业会继续进行。 作业执行完成后,执行以下命令,查看作业信息。 qstat -f 作业ID 如图5所示,作业运行了3分03秒。由此可以看出,作业是从断点的位置进行续算的。 图5 中断后运行作业信息
localhost $ ssh hostname1 依次登录集群中其他ECS,重复执行步骤1~4。 执行以下命令,验证参加测试的ECS之间是否可以免密码互相登录。 假设集群中有2个弹性云服务器,另一个云服务器的主机名为hostname2,则命令行为: $ ssh 用户名@SERVER_IP $ ssh
1.1版本的OpenMPI为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件,HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统
本节指导用户在鲲鹏BMS集群上安装和使用MPICH应用(以版本mpich-3.3.2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装MPICH。 下载MPICH。 下载地址:https://aur.archlinux.org/packages/mpich/
MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install
验证MPI运行在RoCE网络上 执行以下命令,安装iproute2。 yum -y install iproute* 执行以下命令,查看RoCE上是否有流量。 rdma res show 若MPI运行中,回显结果中qp 数量较大(大于1),则证明运行在 RoCE 网络上: 无业务时 有业务时
虚拟私有云(VPC) 为云服务器等云上资源构建隔离、私密的虚拟网络环境。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 7 云硬盘(EVS) 为ECS、BMS等计算服务提供持久性块存储的服务。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 8 对象存储服务(OBS) 提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。
安装和使用MPI 弹性云服务器场景支持使用的MPI IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
"HPC缓存型"文件系统类型。 图2 选择文件系统类型 3.在"创建文件系统"界面的"选择网络"选项中,需注意与购买的弹性云服务器选择相同的网络配置。 4.在"创建文件系统"界面的其他选项中请您根据业务需要,按需填写即可,填写完成后点击购买,完成创建。 图3 完成创建 父主题: 实施步骤
I(以4.0.2版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi-4.0.2.tar.bz2”。 下载地址:https://download.open-mpi
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
/etc/hosts 添加的内容为弹性云服务器的主机名及IP地址,例如 #cat /etc/hosts 192.168.1.3 vm1 192.168.1.4 vm2 ... 执行以下命令,添加hostfile文件。 # vi hostfile 添加的内容为集群中参与测试的弹性云服务器的主机名。 vm1
依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤1.1~步骤1.3,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看ECS的主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤2.1~步骤2.2,获取所有ECS的主机名。
空间之间环境切换的次数。 没有CPU参与:应用程序可以访问远程内存,而不占用远程机器中的任何CPU。远程存储器将被读取,无需任何干预的远程进程(或处理器)。远程CPU中的缓存将不会被访问的内存内容填满。 基于消息的事务:数据被作为离散消息处理,而不是作为流,这消除了应用将流分成不同消息/事务的需要。
在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用