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仅支持CSV格式,数据条数支持100-50000条,文件不大于5MB。 组织共享 如果关闭,则该模型只能自己使用。 如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的模型做分析。 默认为关闭。 单击“确定”。 每人最多可以创建100个模型,每次使用模型时,最多可以使用10个。 查看模型列表
华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 表2 Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述 limit 否 Integer 限制量,单次查询总量[1, 1000],默认100 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100 offset 否 Integer 偏移量,查询起始偏移,默认为0
数据文件列名:选择数据库列名,仅解析前100个列名,支持选择12个列名保存到数据库。 组织共享: 如果关闭,则该数据库只能自己使用。 如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。 默认为关闭。 数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间、状态等信息。对于已创建的数据库,可
模型id。 limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建模型,模型名称为model_name,类型为二分型,上传项目桶中file/test.csv的模型数据,打开共享开关。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug-models
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health
在创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像。同时,您也可以使用自定义镜像,创建Notebook,满足个性化的开发需求。 本章节介绍如何使用自定义镜像创建Notebook(在基础镜像中安装化学分子格式转换工具Open Babel),详细步骤如下所示: 步骤1:安装容器引擎 步骤2:获取Notebook基础镜像
华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 表2 Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述 limit 否 Integer 限制量,单次查询总量,必须由数字组成,默认为100,取值范围[1,1000] 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100 offset 否 Integer
-50。 最大搜索深度:深度增加,每一个路径可进行搜索的深度限制增加,作业运行时间可能延长;深度减少,部分路径可能在还未搜索完成时被终止。默认值5,取值范围3-12。 最大搜索时间:合成路径规划的搜索时间限制,到达限制时间会返回已经搜索完成的路径。搜索时间增加,作业运行时间延长;
Nextflow 简介 安装/卸载Nextflow 新建流程 管理流程 新建作业 管理作业 约束限制 作业执行失败排查思路 父主题: 用户指南(基因平台)
使用前必读 概述 调用说明 终端节点 约束与限制 基本概念
String 请求删除时间 is_core Boolean 是否为核心项目 storage_quota Long 项目数据容量配额,-1表示无容量限制 表4 ProjectRoleRsp 参数 参数类型 描述 role_type String 项目角色名 users Array of BindUserRsp
object task资源限制值 requests TaskInstanceSpecConResRequestRsp object task资源需求值 表12 TaskInstanceSpecConResLimitRsp 参数 参数类型 描述 cpu String CPU限制值 memory
提供了友好、便捷的操作体验,但是当面临大批量的测序数据时,需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率,本章节介绍如何通过循环读取输入数据,批量运行NGS。同时,您也可以参考本示例,将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。 配置命令行工具 批量执行分析需要
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
设置完成后,单击“立即购买”,然后单击“确认”。 在云服务订单页面,单击“确认付款”。 购买成功后,可以在“套餐包”页面查看套餐包信息。 资源包到期后,按需资源不会自动关闭,将会以按需付费的方式继续使用。 超出套餐包部分的用量,将会按需收费。 若平台先到期,套餐包还没到期,则不退套餐包剩余的费用。如果平台续费成功后,套餐包可以继续使用。
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
量。 单击项目名称,在项目页面选择“设置”。 在项目详情页面,单击“已用存储量”后面的。 图6 设置存储容量 开启容量限制开关后,设置最大存储量。 图7 容量限制 设置成功后,单击“确定”。 项目存储量15分钟刷新一次,如果设置了项目最大存储量,项目数据达到最大存储量后,数据上传
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错
finish_end_time 否 Long 最大结束时间。 最小值:1000000000000 最大值:9999999999999 limit 否 Integer 限制量,单次查询总量,必须由数字组成,默认为100,取值范围[1,1000]。 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100 offset 否
若想修改应用的一些参数或删除某些应用,则可以点击每个应用会出现对应的操作图标。例如单击会出现,下方图标分别对应的是修改,删除和复制操作。 构建好流程后单击右上角图标保存,然后关闭当前页面。 步骤3:新建作业 单击作业页面的“新建作业”按钮,并选择需要运行的流程。这里作业名称可以用默认的名称,也可自己更改一个名称。同