、gatk-haplotypecaller应用参数说明 应用名称和版本 应用名称:gatk-applybqsr 版本:4.1.9.0 应用名称:gatk-haplotypecaller 版本:4.1.9.0 镜像和启动命令 镜像:gatk-applybqsr:4.1.9.0 启动命令
应用管理 发布应用 导入应用 订阅应用 获取应用列表 创建应用 获取应用详情 更新应用 删除应用 父主题: 应用管理
应用管理 应用管理 作业管理 自动作业管理 流程管理 流程统计管理 父主题: API(医疗智能体平台)
获取应用详情 功能介绍 获取应用详情 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/apps/{app_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 app_id 是 String 应用id
API(AI辅助药物设计) 分子生成(MG) 分子优化(MO) 靶点化合物结合预测(CPI) 分子属性预测(MPP) 分子搜索(MS) 分子合成路径规划任务(MSP) 自定义属性任务(MCP)
应用管理命令 应用配置文件说明 创建应用 修改应用 查询应用 删除应用 导入应用
下载应用或流程 在“工具”页面选择“流程”或“应用”。 选择需要发布的流程,单击“操作”列“更多”>“下载”。 图1 下载应用 下载内容不包含应用和流程的id,所有引用关系通过名称和版本来指定。 父主题: 工具管理
# 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name: 'demo-app' # 应用名称 取值范围:[1,56],以大小写字母开头,允许出现中划线(-)、下划线(_)、大小写字母和数字,且必须以大小写字母或数字结尾
health docker tag biocontainers/fastqc:v0.11.5 fastqc:v0.11.5 使用health docker push命令上传镜像。
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 apps Array of AppListDto objects 应用列表 count Integer 应用总条数 表5 AppListDto 参数 参数类型 描述 id
错误码(AI辅助药物设计) 当您调用API时,如果遇到“APIGW”开头的错误码,请参见API网关错误码进行处理。 表1 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.03000001 invalid request data 根据错误详细信息检查请求体。
应用场景 靶点发现 在靶点发现阶段,提供蛋白质结构预测、靶点口袋发现功能。 苗头化合物发现 在苗头化合物发现阶段,提供分子对接、口袋分子设计,分子属性预测功能,在分子对接中,预置了大量的分子库可供选择。
响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 app_count Integer 应用总数 workflow_count Integer 流程总数 job_count Integer 作业总数 succeed_job_count Integer 运行成功作业总数
分子搜索(MS) 新建分子搜索任务接口 查询分子搜索任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
分子优化(MO) 新建分子优化任务接口 查询分子优化任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
分子生成(MG) 新建分子生成任务接口 查询分子生成任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
分子属性预测(MPP) ADMET属性预测接口 ADMET属性预测接口(默认+自定义属性) 父主题: API(AI辅助药物设计)
自定义属性任务(MCP) 新建自定义属性任务接口 查询自定义属性任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
步骤1:订阅应用 进入资产市场,分别订阅fasp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。
描述 num_trials Integer 生成分子数量 strong_constraints Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints Array of MoleculeConstraint objects
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