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应用管理 发布应用 导入应用 订阅应用 获取应用列表 创建应用 获取应用详情 更新应用 删除应用 父主题: 应用管理
# 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: id: '' # 应用id name: 'demo-app' # 应用名称 取值范围:
应用管理 应用管理 作业管理 自动作业管理 流程管理 流程统计管理 父主题: API(医疗智能体平台)
API(AI辅助药物设计) 分子生成(MG) 分子优化(MO) 靶点化合物结合预测(CPI) 分子属性预测(MPP) 分子搜索(MS) 分子合成路径规划任务(MSP) 自定义属性任务(MCP)
获取应用详情 功能介绍 获取应用详情 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/apps/{app_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 app_id 是 String 应用id
应用管理命令 应用配置文件说明 创建应用 修改应用 查询应用 删除应用 导入应用
# 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name: 'demo-app' # 应用名称 取值范围:[1,56],以大小写字母开头,允许出现中划线(-)、下划线(_)、大小写字母和数字,且必须以大小写字母或数字结尾
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 apps Array of AppListDto objects 应用列表 count Integer 应用总条数 表5 AppListDto 参数 参数类型 描述 id
下载应用或流程 在“工具”页面选择“流程”或“应用”。 选择需要发布的流程,单击“操作”列“更多”>“下载”。 图1 下载应用 下载内容不包含应用和流程的id,所有引用关系通过名称和版本来指定。 父主题: 工具管理
health docker tag biocontainers/fastqc:v0.11.5 fastqc:v0.11.5 使用health docker push命令上传镜像。
错误码(AI辅助药物设计) 当您调用API时,如果遇到“APIGW”开头的错误码,请参见API网关错误码进行处理。 表1 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.03000001 invalid request data 根据错误详细信息检查请求体。
应用场景 靶点发现 在靶点发现阶段,提供蛋白质结构预测、靶点口袋发现功能。 苗头化合物发现 在苗头化合物发现阶段,提供分子对接、口袋分子设计,分子属性预测功能,在分子对接中,预置了大量的分子库可供选择。
响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 app_count Integer 应用总数 workflow_count Integer 流程总数 job_count Integer 作业总数 succeed_job_count Integer 运行成功作业总数
分子生成(MG) 新建分子生成任务接口 查询分子生成任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
分子搜索(MS) 新建分子搜索任务接口 查询分子搜索任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
分子属性预测(MPP) ADMET属性预测接口 ADMET属性预测接口(默认+自定义属性) 父主题: API(AI辅助药物设计)
步骤1:订阅应用 进入资产市场,分别订阅fasp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。
分子优化(MO) 新建分子优化任务接口 查询分子优化任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
自定义属性任务(MCP) 新建自定义属性任务接口 查询自定义属性任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
应用的参数和镜像启动命令如何设置 创建应用时,需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如,设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时,首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。