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在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
可以利用公有云的跨地域能力,共享计算资源,海量数据,并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器提高30%。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
应用场景 网络密集型应用,例如存储或者集群计算等,需要网络支持大带宽和低时延特性。RDMA的优势相比其他网络应用程序接口,例如Berkeley接口,就是低时延,低CPU负载和大带宽。RoCE可以比iWARP协议要实现更低的时延。 父主题: 主要概念
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt
集群云服务器节点创建完成,但在部署过程中失败了能否修复? 将集群删除,不要勾选“删除云服务器”,使用已有节点部署集群的方法重新部署集群。 父主题: 常见问题
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
解决方案: 1.请检查集群中每个节点的配置文件/etc/dat.conf中"ofa-v2-cma-roe-enp177s0"是否放在首行且每个节点都一致。 2.若以上方法无法解决,请联系技术支持处理。 父主题: 常见问题
创建HPC私有镜像 前提条件 创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像,需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1,选择启动方式为UEFI图2
使用背景 STAR-CCM+运行需要提供一个集群中所有节点均可读取的算例输入文件,通常做法是将算例文件放到NAS存储中,华为云SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储,并针对HPC有优化,建议直接使用华为云SFS Turbo存放算例文件。
说明: 对于HPC集群中的弹性云服务器,需要属于同一VPC、同一子网内。 - 安全组 安全组用来实现安全组内和安全组间弹性云服务器的访问控制,加强弹性云服务器的安全保护。用户可以在安全组中定义各种访问规则,当弹性云服务器加入该安全组后,即受到这些访问规则的保护。
启动集群 操作场景 停止状态的集群,如需再次开启集群执行作业,可将集群重新启动。 只有状态为“停止”的集群可进行启动操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要启动的集群,单击后方操作列“更多 > 启动”。 单击“确定”。
停止集群 操作场景 按需类型的集群,如暂时没有任务需要执行,可使用集群停止功能对集群进行管理操作以节省费用。 包周期资源不适用,关机后仍继续扣费,需手动退订后可停止扣费。 有集群状态为“运行中”的集群可进行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。
STAR-CCM+安装与运行 安装STAR-CCM+ yum install libXt libXext libSM libX11 cd /root unzip siemens.star-ccm15.zip cd Siemens.STAR-CCM+15 tar zxvf STAR-CCM
节点删除时,如果所选节点挂载了数据盘,节点删除时不会删除数据盘,需要用户手动删除清理,否则会继续扣费。 单节点删除操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”; 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。