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String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num
除了不能转移项目、删除项目,其他都可以比如导入成员。 操作员 不能转移项目、删除项目、导入成员,其他都可以。 项目列表中只显示您所在的项目。 一个用户可以是多个项目的成员。 父主题: 项目管理
作业管理 分析作业管理简介 创建分析作业 创建自动作业 查看执行结果 作业执行失败排查思路 父主题: 用户指南(基因平台)
参数 简写 是否必选 描述 --ids -i 否 要导出的id列表,使用job-id导出作业时必选。 job-id 无 否 作业id。 导出多个job-id时,用分号(;)隔开。 格式:id1;id2;id3。 --file -f 否 要导出的id列表文件,使用job-id文件导出作业时必选。
String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num
列是否增加唯一约束,必填 primary: true # 列是否作为主键,必填,若有多个列设为true,则多个列组成复合主键 searchable: true # 列是否可查询,必填 tips:
为保证访问密钥的安全,访问密钥仅在初次生成时自动下载,后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 获取区域名称 区域是一个地理区域的概念,由于带宽原因,会在多个地区建立数据中心,提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四,区域名称为cn-north-4;部署在华东-上海一,区域名称为cn-east-3。
为保证访问密钥的安全,访问密钥仅在初次生成时自动下载,后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 获取区域名称 区域是一个地理区域的概念,由于带宽原因,会在多个地区建立数据中心,提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四,区域名称为cn-north-4;部署在华东-上海一,区域名称为cn-east-3。
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
为保证访问密钥的安全,访问密钥仅在初次生成时自动下载,后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 获取区域名称 区域是一个地理区域的概念,由于带宽原因,会在多个地区建立数据中心,提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四,区域名称为cn-north-4;部署在华东-上海一,区域名称为cn-east-3。
数据作业管理 获取数据作业列表 获取数据作业详细信息 删除数据作业 取消数据作业 重试数据作业 获取数据作业执行日志 下载数据作业执行日志 父主题: 数据管理
作系统。例如,ECS如果为Linux操作系统,可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令,如果显示如下类似信息,表示Docker安装成功。
sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令,如果显示如下类似信息,表示Docker安装成功。 图1 Docker安装成功 步骤2:制作镜像 方法1:直接下载官方的FastQC镜像。 执行如下命令下载FastQC镜像。 docker pull
--storage-path -s 是 notebook存储路径。 包含本项目桶最多挂载6个,不包含本项目桶最多挂载5个。 格式为ProjectName:/path,多个路径用分号(;)隔开。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍e
ge:v1.1 # 执行成功返回结果如下 untagged:lmx-project-02/demo-image:v1.1 删除资产市场订阅的镜像tag。 health docker rmi [AssetMarket]/demo-image:v1.1 # 执行成功返回结果如下 un
常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后,在医疗智能体平台搭建NGS流程,执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能,通过获取示
STAR比对结果所在文件夹。 参数填写无误后,单击界面上方“启动作业”,运行作业。 步骤4:查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业”页签,单击创建的RNA-Seq作业名称,进入详情页,查看执行结果。 图2 执行结果 作业运行完成后,单击应用进度条中的“输出参数”,可跳转至数据所在路径,获取运行结果数据。
策略规则 action String 执行动作 count_before_scale Integer 伸缩前节点数 count_after_scale Integer 伸缩后节点数 state String 执行状态 time String 执行时间 请求示例 查询伸缩历史 https://eihealth
即我们所生成的分子只会往我们所标记的方向生长。如果在一个Substructure约束条件里面添加多个官能团,则官能团之间的关系是“或”,即生成的分子满足其中一个官能团即可。如果添加多个Substructure约束,则官能团之间的关系是“和”,即生成的分子都会满足这几个官能团。 如
-t 否 超时时间。运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟。 --labels -l 否 标签。多个标签使用;符号分隔开。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 对于可选参数,如果命令中包含了特殊字符,