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从源项目lmx-project-02导入镜像到当前项目。 health docker import lmx-project-02/demo-image-1:1.0 # 执行成功返回结果如下 import image succeesfully! 父主题: 镜像管理命令
步骤3:启动作业 在流程页面,单击“启动作业”按钮,根据实际情况填写作业名称等信息。 图5 启动作业 图6 设置作业名称 作业设置完成后,会显示流程中的各个应用信息,再此可以指定实际的运行参数。 图7 NGS流程 单击图标,可设置数据来源,可以指定File或者Directory类型
gatk-mergevcfs、discvrseq-variantqc连线关系 搭建好的流程如下图所示。单击流程设计器上方保存按钮,保存流程。创建好的NGS将显示在“项目管理 > 工具”页签中。 图8 NGS流程 父主题: 基于二代测序的基因组突变检测
分析流程通过流程设计器创建,创建好的流程将存储于项目中。同时,您也可以通过“导入流程”的方法,将隶属于其他项目的流程导入至自己的项目中。 创建好的流程显示在流程列表中,您可以基于这些流程创建分析作业。 详细的流程创建和运行请参见新建流程。 父主题: 用户指南(基因平台)
指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 health docker pull demo-project/demo-image:v1.0 # 执行成功返回结果如下 6be353e4af51: Pull complete Digest: sha256:8c00710a899746ec546
create project demo-project -d description -t 'tag1;tag2;tag3' -p 0101 # 执行成功返回结果如下 create project successfully! project id is xxx. 父主题: 项目管理命令
n。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 无 响应示例 无 状态码 状态码 描述 200 删除配体相似性图计算任务成功响应。 错误码 请参见错误码。 父主题: 药物通用接口
下载命令行工具 使用win键+R,输入cmd打开windows的cmd窗口。进入工具所在的目录,输入health命令,即可使用。 如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录,请使用cd命令切换路径。例如,切换至D盘: cd /d d: 图2 客户端 本示例中以Linux系统为例,介绍安装命令行工具的方法。
"ECFP_4" ] } 响应示例 状态码: 201 CREATED 创建分子搜索作业成功。 { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建分子搜索作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。 { "id" : "ba
ken。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 无 响应示例 无 状态码 状态码 描述 200 删除配体文件预览任务成功响应。 错误码 请参见错误码。 父主题: 药物通用接口
最大长度:512 响应参数 无 请求示例 { "smiles" : "c1ccccc1" } 响应示例 无 状态码 状态码 描述 200 生成SDF成功响应。 错误码 请参见错误码。 父主题: 药物通用接口
-image的类型。 health docker update demo-image --type APP --chip ARM # 执行成功返回结果如下 update image successfully! 父主题: 镜像管理命令
Linux ./health docker push demo-image:v1.0 -d 'this is a desc' -t APP 上传成功返回值 fe4c16cbf7a4: Pushed v1.0: digest: sha256:eb7e3bbd8e3040efa71d9c2
workflow_count Integer 流程总数 job_count Integer 作业总数 succeed_job_count Integer 运行成功作业总数 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "app_count" : 1, "workflow_count" :
true } 响应示例 状态码: 201 CREATED 创建分子属性预测作业成功。 { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建分子属性预测作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。 { "id" : "b
} ] } 响应示例 状态码: 201 CREATED 创建CPI作业成功。 { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建CPI作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。 { "id" :
创建、导入、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 药物虚拟筛选 创建、修改、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 项目列表中只显示您所在的项目。 一个用户可以是多个项目的成员。 父主题: 项目管理
平台支持数据的恢复机制,您可以将归档的核心数据进行恢复,避免造成损失。 数据归档成功后,可以在“归档”页面查看归档记录,并进行恢复、删除操作。归档恢复时,您可以将数据恢复至本项目或有权限的其他项目。 数据归档成功后,选择“归档”页签。 图10 选择归档页签 选择需要恢复的数据,单击操作
kit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health get message --limit 5 # 执行成功返回结果如下 Resource Name Resource Type Message Type Project Name
log提示其它因脚本语法的问题,请根据报错信息进行修改,若无法解决请提交工单或联系服务技术支持。 作业状态已为完成态,task仍在运行中 问题现象 作业的状态已为完成态(失败、成功、取消),但是仍有部分task处于运行中。 解决方案 无需特殊处理,以作业状态为准,查看异常的task日志。 重试作业或者删除作业出现内部异常