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受体信息解析 功能介绍 受体信息解析,如果有多个受体蛋白则只处理第一个,如果一个受体蛋白里结合了多个配体,则最多只处理前10个。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/info
该参数用于获取任务实例事件列表。不带该参数,默认输出任务实例详情(默认json格式)。 --file-path -p 否 获取任务实例详情时,设置任务实例详情下载路径。 --yaml -y 否 获取任务实例详情时,以yaml格式输出任务实例详情(默认json格式)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
否 本地json/yaml格式参数文件路径。 命令示例 health nextflow create workflow -n h2 -w "D:\testzip.zip" -d "h test" -l "a,b" -m "m.nf" -p "D:\param1.json" {
-l 否 流程标签列表,用","分割,如"a,b,c"。 --main_file -m 否 流程主文件名。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 命令示例 health nextflow edit workflow 5b5cd09c-bc14-11ed-b7f6-fa163e504fdd
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
_a45fc9849d217b43.json.gz", "name" : "eiHealth-project_CloudTrace_cn-north-7_2022-02-21T02-31-09Z_a45fc9849d217b43.json.gz", "type" : "FILE"
"分隔,如:"a,b"。 --add-command -a 否 作业额外执行的命令,如:--param1 hello。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 --priority -o 否 作业优先级,支持输入的参数为0-9,默认值为0,0为最低优先级。 命令示例
pdb格式文件,最多上传100个靶点文件,如果上传多聚体靶点,仅解析第一条链,每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。 图2 靶点配置选择文件 输入PDB ID,最多输入100个PDB ID,用逗号或换行方式隔开;不区分大小写;如果输入多聚体靶点,仅解析第一条链;每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。
a45fc9849d217b43.json.gz", "name" : "eiHealth-project_CloudTrace_cn-north-7_2022-02-21T02-31-09Z_a45fc9849d217b43.json.gz", "type" :
参数名 说明 是否必选 示例 Content-type 消息体的类型(格式),默认取值为“application/json”。 是 application/json 例如,对于获取用户Token接口,由于不需要认证,所以只添加“Content-Type”即可,添加消息头后的请求如下所示。
health delete label [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 list -l 否 删除的标签id列表,json数组格式。 命令示例 health delete label -l "[\"1001\",\"1002\"]" delete label
<job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 job-id 不涉及 是 作业ID -- params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径 命令示例 health nextflow retry job f17a3542-3f7c-11eb-868a-fa163e3ddba1
参数名称:fq-file2 数据类型:File 必传:是 默认值:/fastp_2.fq.gz 参数3 参数名称:json-file 数据类型:File 必传:是 默认值:/fastp.json 参数4 参数名称:html-file 数据类型:File 必传:是 默认值:/fastp.html
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter No
cn-north-4.myhuaweicloud.com/v3/auth/tokens Content-Type:application/json { "auth": { "identity": { "methods": ["password"],
自定义镜像创建Notebook样例 Notebook提供了在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码,在创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像。同时,您也可以使用自定义镜像,创建Notebook,满足个性化的开发需求。 本章节介绍如何使用自定义镜像创建Noteboo
fq-file1 file Read1过滤之后输出fq.gz文件。 fq-file2 file Read2过滤之后输出fq.gz文件 json-file file 以JSON文件的格式输出的质控报告。 html-file file 以HTML的格式输出易于阅读的质控报告。 bwa-mem 输入参数
环境配置:加载AutoGenome以及辅助绘图的软件包。 读取配置文件:通过json文件配置输入和输出路径。 模型训练:针对提供的数据和模型参数,AutoGenome会搜索得到最优的神经网络结构。训练过程经过模型搜索阶段和模型训练阶段,在模型搜索阶段,根据json文件中的配置参数,对于选定的模型参数会训练一定
消息头名称 说明 是否必选 Content-Type 用于指明发送给接收者的实体正文的媒体类型。 类型:字符串。 默认值:application/json; charset=UTF-8 是 对于获取用户Token接口,返回如图1所示。 其中“x-subject-token”就是需要获取的用
000条将进行截取。文件必须有两列是“SMILES”、“NAME”,不区分大小写。文件不允许有中文,数据库小分子会自动去重。 数据文件列名:选择数据库列名,仅解析前100个列名,支持选择12个列名保存到数据库。 组织共享: 如果关闭,则该数据库只能自己使用。 如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。