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社区OpenMPI - 高性能计算 HPC
本节指导用户安装和使用社区OpenMPI（以3.1.1版本的OpenMPI为例）。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时，需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件，HPC-X 的下载需要
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RoCE网络问题 - 高性能计算 HPC
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象： dtest/rping打流测试网络双向不通问题：A机器作为Server端，B机器作为Client端，dtest/rping测试RoCE网络异常；调换A、B机器角色，B机器作为Server端，A机器作为C
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安装和使用社区OpenMPI - 高性能计算 HPC
com/networking/hpc-x 将下载的软件包拷贝到BMS内（建议在“/home/rhel”目录下）。 执行以下命令，解压HPC-X工具套件，并修改HPC-X工具套件目录。 # tar -xvf hpcx-v2.2.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-redhat7
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Spectrum MPI - 高性能计算 HPC
下载地址：https://developer.nvidia.com/networking/hpc-x 安装HPC-X工具套件。 将1中下载的HPC-X压缩包上传至运行MPI的弹性云服务器内。 执行以下命令，解压HPC-X工具套件。 $ tar xvf hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4
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制作私有镜像 - 高性能计算 HPC
已确保Linux云服务器网卡设置为DHCP的方式动态获取网络地址。 已清理Linux云服务器中的udev配置规则。 已安装并配置Cloud-init工具。 已卸载Linux云服务器中挂载的所有数据盘。 控制台方式 登录管理控制台。 选择“计算 > 弹性云服务器”。 进入弹性云服务器信息页面。
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创建裸金属服务器集群 - 高性能计算 HPC
用户基于外部镜像创建的个人镜像，仅用户自己可见。包含操作系统、SDI卡驱动、bms-network-config网络配置程序、cloud-init初始化工具以及用户的私有应用。 选择“私有镜像”，并展开“镜像”的下拉框，选择所需的私有镜像。 共享镜像 您将接受其他用户共享的私有镜像，作为自己的镜像进行使用。
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通讯录安装 - 高性能计算 HPC
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
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在HPC集群上运行社区OpenMPI - 高性能计算 HPC
TMOUT=0 执行以下命令，验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令，关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F # service firewalld stop 执行以下命令，给参与测试的弹性云服务器配置主机名。
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HPC和公有云 - 高性能计算 HPC
可以利用公有云的跨地域能力，共享计算资源，海量数据，并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器提高30%。 通过虚拟化优化（SR-IOV、PCI直通）等，各类测试报告显示：大规模云化HPC性能损耗不大。 HPC与云服务的关系 表1 所需云服务 云服务 作用 弹性云服务器（ECS） 用于在公有云平台上创建高性能计算服务器。
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配置BMS集群互相免密登录 - 高性能计算 HPC
免密登录BMS 系统回显结果如图1所示，可以无密钥登录本节点，表示权限配置成功。 依次登录集群中其他BMS，重复执行步骤1～5。 执行以下命令，验证参加测试的BMS之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 父主题： 裸金属服务器场景典型应用
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方案概述 - 高性能计算 HPC
可以利用公有云的跨地域能力，共享计算资源，海量数据，并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化（SR-IOV、PCI直通）等，各类测试报告显示：大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的版本需要提前适配RoCE，请联系技术支持进行操作，建议使用推荐版本运行STAR-CCM+。
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配置ECS集群互相免密登录 - 高性能计算 HPC
$ ssh localhost $ ssh hostname1 依次登录集群中其他ECS，重复执行步骤1～4。 执行以下命令，验证参加测试的ECS之间是否可以免密码互相登录。 假设集群中有2个弹性云服务器，另一个云服务器的主机名为hostname2，则命令行为： $ ssh 用户名@SERVER_IP
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STAR-CCM+启动相关问题 - 高性能计算 HPC
STAR-CCM+启动时，报错“udapl version check failed” 解决方案： 1.请参考通信库安装章节的Udapl安装和测试中在/etc/dat.conf首行加入相应配置，需注意加在首行，放在末尾会出现提示“udapl version check failed”。
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在HPC集群上运行Spectrum MPI - 高性能计算 HPC
使用“PuTTY”，采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令，防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令，验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令，关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables
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RoCE - 高性能计算 HPC
络中。 应用场景 网络密集型应用，例如存储或者集群计算等，需要网络支持大带宽和低时延特性。RDMA的优势相比其他网络应用程序接口，例如Berkeley接口，就是低时延，低CPU负载和大带宽。RoCE可以比iWARP协议要实现更低的时延。 父主题： 主要概念
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在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI - 高性能计算 HPC
使用“PuTTY”，采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令，防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令，验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令，关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables
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RDMA - 高性能计算 HPC
RDMA支持本地处理多个分散/收集条目，即读取多个内存缓冲区并将其作为一个流或获取一个流并将其写入多个内存缓冲区。 RDMA实现 常见的RDMA实现包括虚拟接口架构、基于融合以太网的RDMA(RoCE)、]InfiniBand、iWARP。RDMA的实现方式主要分为InfiniBand和Ether
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