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图1 项目隔离模型 父主题: 使用前必读
图1 选择Terminal 下载和安装Anaconda。 获取Repository和Anaconda安装包。
图1 镜像管理 镜像用途 用于创建分析应用 应用是生物信息学软件的镜像封装。例如,您可将Cell Ranger软件封装为镜像,并上传至EIHealth平台。通过应用把镜像引入,利用应用搭建分析流程,执行分析作业。
图1 命令示例 父主题: 配置命令行工具
String 创建应用时间 update_time String 更新应用时间 user_name String 创建应用的用户名 source_project_name String 源项目名称 source_resource_id String 源资源id icon String 图标
参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 资产名称 最小长度:1 最大长度:56 version 是 String 资产版本 最小长度:1 最大长度:24 title 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 picture 否 String 封面图片
表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 资产名称 最小长度:1 最大长度:56 version 是 String 资产版本 最小长度:1 最大长度:24 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:
图1 镜像列表 【可选】单击“镜像类型”,对上传的镜像进行分类。 上传镜像时如果上传命令中未指定镜像类型,新上传的镜像默认显示为“OTHER”,您可以将镜像标记为“APP”或“NOTEBOOK”。 APP:用于创建应用的镜像。 NOTEBOOK:用于创建Notebook的镜像。
最大长度:64 title 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 summary 否 String 短描述 最小长度:0 最大长度:128 description 否 String 详细描述 最小长度:0 最大长度:65535 picture 否 String 封面图片
最小长度:1 最大长度:128 name 是 String 资产名称 最小长度:1 最大长度:128 version 是 String 资产版本 最小长度:1 最大长度:64 title 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 picture 否 String 封面图片
summary String 资产短描述 license String 许可证 status String 资产状态 failed_reason String 资产发布失败原因 labels Array of strings 资产标签列表 picture String 资产封面图访问链接
图1 下载数据 使用命令行工具下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。
图1 下载命令行工具 使用win键+R,输入cmd打开windows的cmd窗口。进入工具所在的目录,输入health命令,即可使用。 如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录,请使用cd命令切换路径。
图1 新建应用 依据“应用参数说明表”依次创建搭建NGS流程所需的应用。
例如查询下图数据库中第2列,数值大于1数据。-q Ace2_H34::gt::1 --sort-key -k 否 排序字段,只有在--data参数使用时才生效。
图1 下载命令行工具 使用win键+R,输入cmd打开windows的cmd窗口。进入工具所在的目录,输入health命令,即可使用。 如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录,请使用cd命令切换路径。
更新应用时间 user_name String 创建应用的用户名 source_project_name String 源项目名称 source_resource_id String 源资源id node_labels Array of strings 节点标签 icon String 图标
图1 命令示例 初始化配置并设置日志存储路径 health config add -d xxx -u xxx -w xxx -i xxx -r cn-north-4 -o obs.cn-north-4.myhuaweicloud.com -a xxx -s xxx -D https
AppOutputParameterDto objects 应用的输出参数列表 数组长度:0 - 128 node_labels 否 Array of strings 节点标签 取值范围[0,1],单个标签最大长度63字符 最小长度:1 最大长度:63 数组长度:0 - 1 icon 否 String 图标
AppOutputParameterDto objects 应用的输出参数列表 数组长度:0 - 128 node_labels 否 Array of strings 节点标签 取值范围[0,1],单个标签最大长度63字符 最小长度:1 最大长度:63 数组长度:0 - 1 icon 否 String 图标