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false } ] } 响应示例 状态码: 201 配体相似度图任务创建成功响应。 { "id" : "c05ebc2029c24699af2354f67391604c" } 状态码 状态码 描述 201 配体相似度图任务创建成功响应。 错误码 请参见错误码。 父主题: 药物通用接口
success Boolean 相似度计算是否成功。 similarity Float 配体对之间的相似度。 最小值:0 最大值:1 reason String 相似度计算失败的理由。 最小长度:1 最大长度:512 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 查询配体相似性图计算任务成功响应。
删除配体相似性图计算任务 功能介绍 删除配体相似性图计算任务。 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/similarity-graph/{task_id}
Score:代表小分子可合成性的综合打分。 Vina Score:代表分子如果添加了靶点,将会计算对接结合能。 Similarity:靶点口袋分子设计后的分子与原始分子的相似度。 QED:代表分子的成药性。 图4 查看运行结果(1) 图5 查看运行结果(2) 图6 查看运行结果(3) 图7 查看分子详情 图8 查看作业信息
strings 残基列表,当识别模式为残基时提供。 最小长度:4 最大长度:16 数组长度:1 - 32 表4 ReceptorDrugFileReq 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。
yter Notebook的下一代产品,可以使用它编写Notebook、操作终端、编辑MarkDown文本、打开交互模式、查看csv文件及图片等功能。 可以说,JupyterLab是开发者们下一阶段更主流的开发环境。JupyterLab支持更加灵活和更加强大的项目操作方式,但具有和Jupyter
输入小分子。最终以SMILES为准。 选择算法:可以选择ECFP4 Tanimoto相似度或者骨架搜索。ECFP4 Tanimoto相似度是通过ECFP4指纹计算Tanimoto相似度来搜索相似度比较高的小分子。骨架搜索是通过设置分子骨架搜索具有相同骨架的分子。 选择数据库:最多可选择10个数据库。
获取供应商logo和名称设置 使用get命令获取供应商logo和名称配置,默认将供应商logo图片下载到本地路径。 命令结构 health get vendor-config [flags] # 其中vendor-config可简写为vc 命令示例 本节以Windows为例介绍e
算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,基于基因组分析结果,可准确识别病毒基因特性,监测病毒变异趋势,在疫情防控、疾病诊治、药物筛选、疫苗设计与药物研发等工作中发挥着不可替代的基础性的作用;也将支撑病毒溯源、
生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容
路径上的,删除该条待计算路径。 图2 添加或者删除待计算路径 图3 选择配体对 返回相似度后默认全勾选,您可以进行勾选或去除勾选要计算的路径,如果未勾选,则后面就不会对其进行FEP计算。在相似度返回之前,您也可以直接选择配体对进入下一步。 图4 选择计算路径 单击“下一步”,进入FEP设置页面,设置相关参数。
使用Docking Summary流程 分子对接(molecular docking )是分子模拟的重要方法之一,其本质是两个或多个分子之间的识别过程,其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。分子对接方法在药物设计、材料设计等领域有广泛的应用。 在药物分子产生药效反应的过程中,药物分
”。一般私密数据不建议用此方法。 目前仅支持访问用户个人OBS下的链接,不支持读取其他用户公共读的链接。 上传待检测的图片 请参见OBS文档上传对象。 获取图片URL 请参见OBS文档获取对象URL。 父主题: 附录
创建数据库模板 创建数据库前,请先在“数据库 > 模板”页签创建数据库模板,模板中数据库表列的数目为固定,行数可按需设置,不同列之间,可通过列信息进行识别。列信息包含列名、描述、类型、允许为空、是否主键、是否可查询、是否唯一、提示和操作信息。单击添加列可新增一列,最多支持100列。单击操作列的图标可以删除列。
File 文件流对象 name 是 String 供应商名称 最小长度:1 最大长度:30 响应参数 无 请求示例 设置供应商配置,设置名称,上传图片 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/vendor-config
聚类分析 聚类分析工具可以通过骨架聚类方法,将大型小分子数据库中结构相似的化合物聚成一类,从而找到有效骨架 ,辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片,进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式:选择文件和手动输入类型。 上传分子文件:选择
划线,下划线和点号。 类型 镜像。 标签 设置发布镜像的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的镜像设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 * 9 大小:不超过20KB 描述 针对此镜像的相关描述。 单击“立即发布”。
里面进行设置。“最小化”指的是所设置的属性越小越好,与最大化相反,也是只能在弱约束里面进行设置。 相似度分数,是利用ECFP4分子指纹计算生成后分子与原始分子的Tanimoto相似性。我们设置了禁止优化列表,禁止以高毒性为优化目标的属性优化,列表为:hERG Blockers,H-HT,DILI,AMES,Skin
特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。 类型 应用。 标签 设置发布应用的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的应用设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 * 9 大小:不超过20KB 描述 针对此应用的相关描述。 单击“立即发布”。
特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。 类型 流程。 标签 设置发布流程的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的流程设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 * 9 大小:不超过20KB 描述 针对此流程的相关描述。 单击“立即发布”。