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AI药物研究 父主题: 图解医疗智能体
AI基因组研究 父主题: 图解医疗智能体
分子搜索作业管理 创建分子搜索作业 查询分子搜索作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
试作业”。 搜索 普通搜索 在作业管理页面,右上角搜索框中输入作业名称,单击按钮进行搜索。 图3 搜索作业 高级搜索 Nextflow作业支持根据流程名称、标签、状态、创建者、创建时间、完成时间进行搜索。在作业管理右上角,选择“高级搜索”,输入搜索条件后,单击“搜索”即可查找出相关信息。
终止。默认值5,取值范围3-12。 最大搜索时间:合成路径规划的搜索时间限制,到达限制时间会返回已经搜索完成的路径。搜索时间增加,作业运行时间延长;搜索时间减少,可能会有部分合理路径未能开始搜索。默认值30min,取值范围5-60。 每个产物最大反应数量:合成路径中每一个中间产物
径。 模型训练:针对提供的数据和模型参数,AutoGenome会搜索得到最优的神经网络结构。训练过程经过模型搜索阶段和模型训练阶段,在模型搜索阶段,根据json文件中的配置参数,对于选定的模型参数会训练一定步数,搜索得到较好结果的参数进行后续训练。训练过程中可选择在验证数据集上进
Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 mode 是 String 口袋识别的模式:自动、全局、配体、残基。 枚举值: AUTO GLOBAL LIGAND RESIDUES receptor_file 是 ReceptorDrugFileReq
购买CSS资源 登录CSS云搜索服务。 单击“创建集群”。 图1 创建集群 基础配置:选择“计费模式”、“当前区域”。 集群类型选择“Elasticsearch”,输入集群名称。 图2 基础配置 节点规格:参考自己的数据库大小。自定义数据库所需要的的CSS节点规格大于“4 vCPUs
如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。 默认为关闭。 数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间、状态等信息。对于已创建的数据库,可以执行删除和追加数据操作。数据库状态介绍如下: 可用:数据库正常,可以进行分子搜索使用。 等待中:数据库创建任务正在等待。 创建失败:数据库创建失败。
可对作业执行重试、取消、删除、克隆、导出操作。对于列表中的作业,支持通过作业名称、流程名称、标签、创建者、状态、创建时间和完成时间进行快速搜索。 如果需要批量创建分析作业,您可以创建自动作业。 当作业执行超时,作业状态显示失败,task状态为运行中。后续task运行成功或失败,作
在平台右上角用户名中选择“系统设置”,设置邮件配置。 服务器地址:邮箱开通SMTP功能时的服务器地址,不同邮箱开通SMTP方式不同,请使用搜索引擎查找邮箱开通SMTP方式。 邮箱地址:填写邮箱地址,用于发送EIHealth平台的消息通知。 用户名:邮箱的用户名,如果未修改过,默认为邮箱地址。
小分子通常为低分子量的化合物,如蛋白质配体;大分子多为蛋白质靶点。 小分子涉及分子对接、分子优化、靶点口袋分子设计、CPI、分子生成、分子搜索、FEP、聚类详情页。 大分子涉及靶点口袋发现、靶点优化。 使用限制 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 如果收藏分子的源作业被删除,收藏列表依旧可以正常展示。
间、运行状态、总时长、运行时长、已运行时间、预计还需时间。对于列表中的作业,支持通过作业名称、状态、类型、标签、创建时间和完成时间进行快速搜索。也可以根据创建时间顺序、总时间顺序、总时长顺序、完成时间顺序等进行排序。 图1 作业中心 父主题: 作业管理
图16 删除资源 查找资源 普通搜索:在搜索框中输入关键字,单击按钮查找资源。 图17 查找资源 高级搜索:计算资源支持按照名称、运行状态、计费模式、规格名称、标签进行搜索。 输入某一项搜索条件后,单击“搜索”即可查找出相关信息。 图18 高级搜索 资源统计 计算资源支持选择一部分节点,统计出对应节点的资源使用量。
可以在dockerhub官网上进行搜索,选择出对应的名称与版本。 可以使用docker search fastqc命令进行搜索镜像。 若dockerhub上没有想要的镜像,可以利用基础的操作系统镜像进行构造,构造方式请参见用户指南。 选择和获取镜像。 搜索到的镜像列表中选择一个fast
在“删除标签”弹窗中,单击“确定”。 批量删除标签 您可以一次选中多个标签,单击页面左上角的删除按钮即可。 图2 批量删除标签 查找标签 在搜索框中输入标签名称关键字,单击按钮进行查找。 图3 查找标签 父主题: 系统设置
在“删除标签”弹窗中,单击“确定”。 图3 删除标签 批量删除标签 您可以一次选中多个标签,单击页面左上角的删除按钮即可。 图4 批量删除标签 查找标签 在搜索框中输入标签名称关键字,单击按钮进行查找。 图5 查找标签 父主题: 系统设置
下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 单个受体对多个配体的结果页面有列表视图、卡片视图,支持搜索、高级筛选,排序等功能。每个小分子支持“查看详情”可以进入小分子的属性详情页;支持“下游分析”,可以进行分子属性预测、分子搜索、分子优化、合成路径规划分析。支持收藏功能,单击按钮,即可收藏CPI预测结果,收藏后可直接在收藏夹页查看。
查看执行结果 作业运行完成后,可以在“作业中心”页面,单击作业名称,查看输出结果和作业信息。 输出结果 当作业执行成功后,可以在作业中心页面,单击作业名称,查看输出结果。 在输出结果中可以查看下载某个任务或者全部任务的信息,可以在操作列查看3D、合成路径等信息。 图1 输出结果-列表视图
新”。 “作业状态更新”中可选“选择已有列”或“新建一列”。 选择“选择已有列”时,需要选择已有列名,已有列名必须为string类型,可以搜索到,并且非主键。 并设置是否“清空作业状态更新列”,状态更新列的值为空的数据才会投递作业。 选择“新建一列”,需要输入新建的列名。 图2 设置作业基本信息