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行修改后,单击“重试作业”。 搜索 普通搜索 在作业管理页面,右上角搜索框中输入作业名称,单击按钮进行搜索。 图3 搜索作业 高级搜索 Nextflow作业支持根据流程名称、标签、状态、创建者、创建时间、完成时间进行搜索。在作业管理右上角,选择“高级搜索”,输入搜索条件后,单击“搜索”即可查找出相关信息。
类型为bash:操作与Linux系统相同。 类型为zsh:执行history -p命令清除历史记录,重新登录命令行工具后,记录可恢复。执行rm -rf ~/.zsh_history命令,退出终端后再次执行history -p命令可删除记录文件,清空历史。 Windows系统:对于当前执行的命令,可通过关闭cmd窗口实现历史命令的清理。
4-5,单位:Å。 名称:可修改,修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符;仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格;首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:运行一次功能会消耗一次。 单击“提交”。 提交成功后,可以在“作业中心”查看执行结果。
查看订阅的数据 步骤3:启动作业 在流程页面,单击“启动作业”按钮,根据实际情况填写作业名称等信息。 图5 启动作业 图6 设置作业名称 作业设置完成后,会显示流程中的各个应用信息,再此可以指定实际的运行参数。 图7 NGS流程 单击图标,可设置数据来源,可以指定File或者Director
删除的核心项目,将进入“待删除项目”列表中。待删除项目会保留7天,6天内您可以将项目恢复成可用状态,最后一天不支持恢复。7天后,项目将自动删除,删除后不可恢复。非核心项目支持立即删除。 图5 项目状态 父主题: 项目管理
应范围数量增加,作业运行时间延长;最大反应数量减少,可能会有部分合理反应未能纳入搜索。默认20,取值范围2-20。 作业名称:可修改,修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符;仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格;首位只能以数字或字母开头。 标签:设置作业标签。
输出文件格式:可以将流程生成的分子对接结果,保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking Summary”流程时,保存格式为.txt。 相对路径:流程运行完成后,会按照流程子任务的名称生成数据文件,相对路径指按照哪个数据路径中的结果文件生成数据库。 对于“Docking Summary”流程,包含5
、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 图1 添加标签 单击“确定”,标签添加完成。系统最多可添加100个标签。 删除标签 标签删除后不可恢复,请谨慎操作。 在“标签管理”页面,单击操作列的“删除”。 在“删除标签”弹窗中,单击“确定”。 批量删除标签 您可以一次选中多个标签,单击页面左上角的删除按钮即可。
克隆已有的作业,作业的参数及流程一并克隆到新作业中。 在“作业中心”页面,单击作业操作列的“克隆”。 在作业详情页面修改对应的参数信息。 参数确认无误后,单击“提交”按钮。 父主题: 作业管理
一步高级配置”。 图4 网络配置 单击“下一步:高级配置”,在弹窗里单击“确认”。 图5 确认 高级配置。 图6 高级配置 确认配置,无误后单击“立即创建”,即可完成购买。 图7 确认配置 父主题: 准备工作
SS资源界面。 单击“绑定”进入绑定界面,选择要绑定的CSS集群名称、填写管理员账户名和管理员密码。 单击“测试链接”验证用户名或密码无误后单击“确定”,即可完成绑定(可选项)。您也可以单击操作列的“解除绑定”来解除当前的绑定。 图1 绑定CSS资源入口 图2 绑定CSS资源 父主题:
目录,故无需指定destdir。 --md5s -m 否 网络下载链接对应的md5列表,值用; 分隔,和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍ei
使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health download
访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全,访问密钥仅在初次生成时自动下载,后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 父主题: 数据管理
如果需要批量创建分析作业,您可以创建自动作业。 当作业执行超时,作业状态显示失败,task状态为运行中。后续task运行成功或失败,作业状态都显示失败。可参考作业投递后处于运行中,运行过程正常,但是最后超时失败进行处理。 如果性能加速节点不可用或作业配额不足,重试作业时,超过配额的作业会重试失败。 图1 分析作业
、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 图2 添加标签 单击“确定”,标签添加完成。系统最多可添加100个标签。 删除标签 标签删除后不可恢复,请谨慎操作。 在“标签管理”页面,单击操作列的“删除”。 在“删除标签”弹窗中,单击“确定”。 图3 删除标签 批量删除标签 您可
类型为bash:操作与Linux系统相同。 类型为zsh:执行history -p命令清除历史记录,重新登录命令行工具后,记录可恢复。执行rm -rf ~/.zsh_history命令,退出终端后再次执行history -p命令可删除记录文件,清空历史。 windows系统:对于当前执行的命令,可通过关闭cmd窗口实现历史命令的清理。
面显示。 上传数据 选择数据需要上传的文件夹,并单击“添加数据”或者直接单击“添加数据”。 在添加数据页面,上传待分析数据。 数据上传成功后,单击“确定”。 上传文件大小不能超过1GB。最多不能超过20个文件。 复制数据 将其他项目或本项目的数据,复制到本项目中,并可在本项目中操作该数据。
-M 否 列举桶内对象的起始位置,返回结果是按照字典序排序后该参数之后的所有对象,具体可参考列举示例。 --versionIdMarker -V 否 列举桶内多版本对象的起始位置,返回结果是对象名和版本号按照字典序排序后该参数之后的所有对象。 必须与--v和--marker配合使用。
最小可以上传0Byte的空文件或文件夹,最大可以上传48.8TB的单个文件。 数据在上传的过程中,受网络影响可能出现损坏,上传命令默认会在上传完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health upload