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directory 转换后存放配体3D sdf文件的文件，默认文件名为3d.sdf。 ligand-3dsdf-to-pdbqt 输入参数 dir-in directory 存放配体3D sdf文件的文件，默认文件名为3d.sdf。 输出参数 dir-out directory 转换后存放配体pdbqt文件的文件夹。
作业加速类型选择IO加速或者本地盘加速，则此处task加速类型无法设置。 参数确认无误后，单击页面上方“启动作业”按钮，可以直接基于该流程创建自动分析作业。 查看作业运行结果 自动作业运行完成后，在自动作业列表中单击数据表名称，跳转至对应的数据表中。在设置的状态更新列中，单击执行
在linux环境上配置docker环境。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 配置完成后，运行docker命令，可查看docker的信息。 图1 docker信息 构建fastqc镜像。 可以在dockerhub官网上进行搜索，选择出对应的名称与版本。
流程搭建完成后，单击“新建作业”。 图1 新建作业 在新建作业弹窗中单击“确定”。 图2 新建作业 在弹出的作业设置页面，填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”，选择需要执行的流程，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”、“加速类型”。设置完成后单击“确定”。
较好结果的参数进行后续训练。训练过程中可选择在验证数据集上进行评估，评估结果更好的模型参数将会保留。 提取降维之后数据：完成模型训练后，生成降维后的结果数据。 当您在运行AutoGenome示例出现“Warning：restart the kernel and run the notebook
查看药筛作业和结果下载 查看作业进程 用户可以在“项目 > 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”，获取输出结果的路径。 文件的命名方式为：蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2
行修改后，单击“重试作业”。 搜索 普通搜索 在作业管理页面，右上角搜索框中输入作业名称，单击按钮进行搜索。 图3 搜索作业 高级搜索 Nextflow作业支持根据流程名称、标签、状态、创建者、创建时间、完成时间进行搜索。在作业管理右上角，选择“高级搜索”，输入搜索条件后，单击“搜索”即可查找出相关信息。
类型为bash：操作与Linux系统相同。 类型为zsh：执行history -p命令清除历史记录，重新登录命令行工具后，记录可恢复。执行rm -rf ~/.zsh_history命令，退出终端后再次执行history -p命令可删除记录文件，清空历史。 Windows系统：对于当前执行的命令，可通过关闭cmd窗口实现历史命令的清理。
查看订阅的数据 步骤3：启动作业 在流程页面，单击“启动作业”按钮，根据实际情况填写作业名称等信息。 图5 启动作业 图6 设置作业名称 作业设置完成后，会显示流程中的各个应用信息，再此可以指定实际的运行参数。 图7 NGS流程 单击图标，可设置数据来源，可以指定File或者Director
删除的核心项目，将进入“待删除项目”列表中。待删除项目会保留7天，6天内您可以将项目恢复成可用状态，最后一天不支持恢复。7天后，项目将自动删除，删除后不可恢复。非核心项目支持立即删除。 图5 项目状态 父主题： 项目管理
应范围数量增加，作业运行时间延长；最大反应数量减少，可能会有部分合理反应未能纳入搜索。默认20，取值范围2-20。 作业名称：可修改，修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符；仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格；首位只能以数字或字母开头。 标签：设置作业标签。
、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 图1 添加标签 单击“确定”，标签添加完成。系统最多可添加100个标签。 删除标签 标签删除后不可恢复，请谨慎操作。 在“标签管理”页面，单击操作列的“删除”。 在“删除标签”弹窗中，单击“确定”。 批量删除标签 您可以一次选中多个标签，单击页面左上角的删除按钮即可。
一步高级配置”。 图4 网络配置 单击“下一步：高级配置”，在弹窗里单击“确认”。 图5 确认 高级配置。 图6 高级配置 确认配置，无误后单击“立即创建”，即可完成购买。 图7 确认配置 父主题： 准备工作
克隆已有的作业，作业的参数及流程一并克隆到新作业中。 在“作业中心”页面，单击作业操作列的“克隆”。 在作业详情页面修改对应的参数信息。 参数确认无误后，单击“提交”按钮。 父主题： 作业管理
输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking Summary”流程时，保存格式为.txt。 相对路径：流程运行完成后，会按照流程子任务的名称生成数据文件，相对路径指按照哪个数据路径中的结果文件生成数据库。 对于“Docking Summary”流程，包含5
SS资源界面。 单击“绑定”进入绑定界面，选择要绑定的CSS集群名称、填写管理员账户名和管理员密码。 单击“测试链接”验证用户名或密码无误后单击“确定”，即可完成绑定（可选项）。您也可以单击操作列的“解除绑定”来解除当前的绑定。 图1 绑定CSS资源入口 图2 绑定CSS资源 父主题：
目录，故无需指定destdir。 --md5s -m 否 网络下载链接对应的md5列表，值用; 分隔，和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍ei
使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地，此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中，受网络影响可能出现损坏，下载命令默认会在下载完成后，验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性，以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health download
如果需要批量创建分析作业，您可以创建自动作业。 当作业执行超时，作业状态显示失败，task状态为运行中。后续task运行成功或失败，作业状态都显示失败。可参考作业投递后处于运行中，运行过程正常，但是最后超时失败进行处理。 如果性能加速节点不可用或作业配额不足，重试作业时，超过配额的作业会重试失败。 图1 分析作业
访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全，访问密钥仅在初次生成时自动下载，后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 父主题： 数据管理
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