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task-4-qvina-w:分子对接。 task-5-docking summary:汇总分子对接结果。 图3 数据路径和流程图 图4 设置数据库 设置完成后,单击“提交”,执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务,单击图标,允许取消、强制停止或删除。 对于“已取消”、“运行失败
tools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤,进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig,根据contig下发对应的任务,并依据不同任务,指定并行下发的任务数,以降低流程整体的运行时间。 流程执行信息 NGS流程由fast
作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回。 user_name
--obs-endpoint -o 否 OBS终端节点名称,请在地区与终端节点中获取。 --obs-install-path -q 否 设置obsutil安装路径,默认安装在当前运行目录。 设置时,该路径必须为obsutil运行文件名,如/home/path/obsutil、/home/path/obsutil-1
选择IAM用户登录,填写账号名、IAM用户名、密码,登录平台。 账号名:与管理员(购买平台的账户)的账号名一致。 IAM用户名、密码:创建子用户时设置的用户名和密码。 图2 IAM用户登录界面 父主题: 用户管理
单击流程名称,进入流程详情页面,单击流程文件后的“下载”,可下载该流程文件。 下载流程参数 单击流程名称,进入流程详情页面,单击流程参数后的“下载”,可下载该流程设置的参数文件。 图1 下载流程文件/参数 父主题: Nextflow
图4 拖拽应用 设置输入、输出关系。 fastp的两个输出参数fq-file1和fq-file2是bwa-mem算法的输入参数,bwa-mem的sorted-bam参数是bamqc与picard-insertsize输入参数,参考图进行连接。 图5 设置输入、输出关系 若想修
单击“新建应用”,创建fastqc应用。 图3 设置镜像名称、版本等信息 镜像启动命令如下所示。镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量,并以大括号{}扩起,以$符号进行引用。 fastqc -f fastq -o ${output-dir} ${input-file} 图4 设置CPU、内存、输入输出参数
后,平台不会进行删除(恢复到项目桶中的数据会正常收取标准存储的费用)。 在归档管理页面,可以在“归档天数”列查看已归档天数(从归档复制完成时间开始算)。若用户早于90天删除归档数据,将收取费用,收取的费用=对应存储类别存储空间按需月单价*容量*剩余天数/30,超过90天不需要补。
查看的文件、文件夹对象。 注意: 如果为引用数据,必须要使用绝对路径(文件夹最后要加/)。未引用的数据不能查看。 --bf -b 附加参数,可选 设置是否以人方便阅读方式输出结果。取值包括:human-readable、raw。 --e -P 附加参数,可选 指定终端节点。 --i -i
除等操作。 数据总条数<=10000,页面上可以指定跳转具体页码。 数据总条数>10000,通过“下一页”和“上一页”进行页面切换,并且按时间排序只能对当前页面进行排序,页面搜索为按前缀搜索。 使用合规数据 您添加的数据属于您的内容,您应对您的内容的合法合规性负责,建议您根据对您
除等操作。 数据总条数<=10000,页面上可以指定跳转具体页码。 数据总条数>10000,通过“下一页”和“上一页”进行页面切换,并且按时间排序只能对当前页面进行排序,页面搜索为按前缀搜索。 使用合规数据 您添加的数据属于您的内容,您应对您的内容的合法合规性负责,建议您根据对您
行最多输入1024个字符,SMILES不支持输入空格或者中文。 作业名称:设置作业名称。长度为5~64个字符,仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格,首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:100000个小分子记一次功能调用。 配置完成后,单击“提交”。
最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 favorite_id 是 String 收藏ID。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数
流程设计器界面由工具栏、资源栏和画布三部分构成。 图1 流程设计器界面 表1 界面说明 区域 说明 工具栏 上方的工具栏显示设计器的快捷控制操作。 由设置、新建作业、保存、另存为、删除、自动保存构成。 资源栏 左侧的资源栏显示项目中可以使用的应用和流程。 画布 中间区域为搭建流程的操作界面。
-x 否 查询任务完成起始时间。例如,2006-01-02 15:04:05。 --finish-to-time -y 否 查询任务完成结束时间。例如,2006-01-02 15:04:05。 --create-from-time -c 否 询任务创建起始时间,例子:--create
name String css集群名称。 storage Integer css集群总存储。 import_time String css集群导入时间。 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "count" : 1, "css_clusters" : [ {
医疗智能体平台API 类型 API 说明 项目管理 项目管理 项目创建、获取项目详情、删除项目等相关操作API。 系统管理 系统管理 系统设置、系统资源、用户管理、消息中心、标签等相关操作API。 镜像管理 标签页面管理 导入镜像、更新镜像、创建镜像、删除镜像等相关操作API。 数据管理
下游分析:靶点口袋分子设计对应的下游分析为分子优化、自由能微扰、合成路径规划和分子搜索,单击“确定”即可创建。 下载3D:如果分子设置了靶点,可以单击“下载3D”下载优化后的小分子或者复合物,如果分子未设置靶点,单击“下载3D”只能下载小分子。小分子下载支持SDF和PDB格式,复合物支持PDB格式。 每个分
只有项目所有者和管理员能修改。 --tags -t 否 项目标签,多个标签使用分号(;)分隔。 只有项目所有者和管理员能修改。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。只有项目所有者能修改。 用数字0和1表示关闭和打开,以data-share、data-download、data-de