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STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
常见的标准操作系统镜像,所有用户可见,包括操作系统以及预装的公共应用。请根据您的实际情况自助配置应用环境或相关软件。 选择“公共镜像”,并展开下拉框,选择所需的公共镜像。 私有镜像 用户基于弹性云服务器创建的个人镜像,仅用户自己可见。包含操作系统、预装的公共应用以及用户的私有应用。
该节点不在当前账号下的其他集群中。 选择“安全组” 安全组为选定的管理节点所使用的安全组策略,如果有多个策略,可根据需要选择。 选择“计算节点” 计算节点的筛选需要满足以下条件: 当前指定区域的ECS节点。 计算节点状态为“运行中”。 计算节点与管理节点为相同的CPU架构。 计算节
此时,pbs作业回到queued状态,等待可用的计算资源。 开机2中关闭的计算节点,提供可用的计算资源。 此时,pbs作业会继续进行。 作业执行完成后,执行以下命令,查看作业信息。 qstat -f 作业ID 如图5所示,作业运行了3分03秒。由此可以看出,作业是从断点的位置进行续算的。 图5 中断后运行作业信息
需的私有镜像。 共享镜像 您将接受其他用户共享的私有镜像,作为自己的镜像进行使用。 选择“共享镜像”,并展开“镜像”的下拉框,选择所需的共享镜像。 选择“许可证类型”。 在云平台上使用操作系统或软件的许可证类型。如果您选择的镜像为免费的,则系统不会展示该参数。如果您选择的镜像为计费镜像,此时系统会展示该参数。
为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。如您最多可以创建多少台弹性云服务器、多少块云硬盘。 如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以申请扩大配额。 怎样查看我的配额? 登录管理控制台。 单击管理控制台左上角的,选择区域和项目。 在页面右上角,选择“资源 > 我的配额”。
执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图3 在单个BMS上运行Intel MPI
操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install
执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello 图3 在单个BMS上运行MPICH 父主题:
安装和使用Platform MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi- 09.01.04.03r-ce.bin为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。
依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本3.1.0rc2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。
} $ mpicc hello.c -o hello 不同版本的MPI运行的hello文件是不同的,都需要使用命令mpicc hello.c -o hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(3.1.0rc2版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。
依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 该任务指导用户在鲲鹏BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(以版本4.0.2a1为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。
依次登录集群中所有BMS,重复执行步骤1.2~步骤1.3,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS, 执行以下命令,添加hosts配置文件。 # vi /etc/hosts 添加的内容为集群中所有BMS的私网IP和主机名,例如: 192.168.1.138 bms-arm-ib-0001
在HPC集群上运行Intel MPI 操作场景 该任务指导用户在ECS集群(以CentOS7.3为例)上运行Intel MPI应用(l_mpi_2018.0.128版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。