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源满足的作业。例如,资源有2u2g,低优先级的需要1.8u1.8g,高优先级的需要2.2u2.2g,则低优先级的会先投递。但是两者都是1.8u1.8g,高优先级的先投递。 图1 新建作业 单击“确定”,进入启动作业页面。 (可选)在启动作业页面,可以通过,添加作业相关参数。 上传参数的模板可以通过单击进行下载。
(_)组成,以大小写字符或数字结尾。 最小长度:1 最大长度:32 app_id 是 String 应用id,取值范围[1,135],正则先不能有中文,两种格式。特殊id,采用{app_name}::{app_version}::{src_project_name}格式,用于手动
完整描述文本 labels: # 可选 # 标签 - labelA - labelB image: 'xxxx' # 必选 # 镜像地址 commands:
project -d "详细描述" -s "简要描述" -o "/data/output" -t 2000 -l "labelA;labelB" # 返回结果如下 edit workflow succeed! 父主题: EIHealth流程管理命令
(_)组成,以大小写字符或数字结尾。 最小长度:1 最大长度:32 app_id 是 String 应用id,取值范围[1,135],正则先不能有中文,两种格式。特殊id,采用{app_name}::{app_version}::{src_project_name}格式,用于手动
"summary", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "update_time" :
"summary", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "update_time" :
"demo-workflow", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "update_time" :
get project命令查询当前账号下所拥有的项目和项目信息。Linux系统下,需添加./指定当前路径。 使用数据、应用、流程、作业命令时,需先使用switch命令进入待操作的项目中。使用逻辑与EIHealth平台一致,进入项目,再对项目内的数据等内容进行操作。 命令行的参数缩写支持合并使用,例如,-r
)或斜杠(/)开头或结尾。 不能包含两个以上相邻的斜杠(/)。 文件夹名称不能以中划线(-)开头。 多层文件夹不能超过45层。 数据列表按照先文件夹后文件的顺序排列。文件夹默认为首字母排序,文件可按照时间顺序排序,但始终在文件夹后面显示。 上传数据 选择数据需要上传的文件夹,并单击“添加数据”或者直接单击“添加数据”。
选择CPU、GPU类型和大小,选择内存大小,内存单位为GB。 CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型,以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如,GATK是基于X86指令集开发的生信软件,使用CentOS的X86系统创建GATK镜像,则在创建应用时选择“X86”。
)或斜杠(/)开头或结尾。 不能包含两个以上相邻的斜杠(/)。 文件夹名称不能以中划线(-)开头。 多层文件夹不能超过45层。 数据列表按照先文件夹后文件的顺序排列。文件夹默认为首字母排序,文件可按照时间顺序排序,但始终在文件夹后面显示。 上传数据 选择数据需要上传的文件夹,并单击“添加数据”或者直接单击“添加数据”。
app-name:version:srcproject -d "详细描述" -s "简要描述" -c "fastqc" -l "labelA;labelB" # 返回结果如下 edit app succeed! 父主题: 应用管理命令
"demo-job", "description" : "description", "labels" : "labelA,labelB", "workflow_id" : "caadcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 响应示例 状态码:
"demo-workflow", "description" : "description", "labels" : "labelA,labelB", "workflow_file" : "(binary)", "main_file" : "main.nf" } 响应示例 状态码:
"demo-workflow", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "update_time" : "2021-01-30T02:53:26Z"
目信息,执行health get project test-zh-0507命令。 指定“--current”和“--policy”参数。 先执行health switch project test-zh-0507,切换到“test-zh-0507”项目,再执行health get
工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1.连接容器镜像服务操作,然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。 # 基础镜像 docker pull swr.cn-north-4
"demo-job", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "COMPLETED", "has_ignore_failed_tasks" : false,
63e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "OPTIMIZATION", "create_time"