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如何搭建Docker环境 制作Docker镜像,有以下两种方法。 快照方式制作镜像(偶尔制作的镜像):在基础镜像上,比如Ubuntu,先登录镜像系统并安装Docker软件,然后整体制作快照,即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像(经常更新的镜像):
切换项目 使用switch命令切换到指定的项目中。 使用该命令前,您需要先创建项目,再使用switch命令进入该项目。 命令结构 health switch project <project-name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 是
错误码(医疗智能体与盘古辅助制药平台) 当您调用API时,如果遇到“APIGW”开头的错误码,请参见API网关错误码进行处理。 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.01040001 Invalid template content. 检查模板内容是否符合格式要求。
图2 查看订阅的流程 步骤2:订阅数据 若您本地有需要分析的二代基因组数据,则您可以用本地的数据。数据上传方法请参见上传数据。 若没有,可以先订阅资产市场里的示例数据进行分析,这里先用资产市场中的“人类基因组数据”和“NGS小数据集”进行分析。 图3 订阅数据 可以在“数据”列表可以看到刚刚订阅的流程。
错误码(AI辅助药物设计) 当您调用API时,如果遇到“APIGW”开头的错误码,请参见API网关错误码进行处理。 表1 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.03000001 invalid request data 根据错误详细信息检查请求体。 400
发布流程 您可以将创建的流程发布到资产市场,供其他项目订阅和使用。 发布资产前,需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“流程”。 选择需要发布的流程,单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面,填写发布流程的相关信息。 表1 发布流程参数说明 参数 说明 名称
5],标签名称长度为1~32,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 - labelA - labelB timeout: 1440 # 流程超时时间,取值范围[1,144000],单位分钟,默认1440
完整描述文本 labels: # 可选 # 标签 - labelA - labelB timeout: 1440 # 可选 # 流程超时时间,取值范围[1,144000],单位分钟,默认1440
流程参数列表文件,取值范围[0, 10M] 响应参数 无 请求示例 更新Nextflow流程,修改流程描述为description,标签为labelA,labelB,流程主文件为main.nf https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{proj
表明服务端能被请求访问到,但是不能理解用户的请求。 501 Not Implemented 服务器不支持请求的功能,无法完成请求。 502 Bad Gateway 充当网关或代理的服务器,从远端服务器接收到了一个无效的请求。 503 Service Unavailable 被请求的服务无效。 建议直接修改该请求,不要重试该请求。
注册华为账号并开通华为云,并进行账号实名认证。购买服务时,账号不能处于欠费或冻结状态。 购买服务时,需使用华为主账号购买。如果不确定账号类型,可登录账号中心查看所属账号是主账号还是子账号(IAM账号)。 在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签,则说明是子账号;没有“我的主账号”页签,则说明是主账号。 图1 查看账号信息
注册华为账号并开通华为云,并进行账号实名认证。购买服务时,账号不能处于欠费或冻结状态。 购买服务时,需使用华为主账号购买。如果不确定账号类型,可登录账号中心查看所属账号是主账号还是子账号(IAM账号)。 在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签,则说明是子账号;没有“我的主账号”页签,则说明是主账号。 图1 查看账号信息
5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 - labelA - labelB timeout: 1440 # 流程超时时间,取值范围[1,144000],单位分钟,默认1440
制作Docker镜像 制作Docker镜像,有以下两种方法。 快照方式制作镜像(偶尔制作的镜像):在基础镜像上,比如Ubuntu,先登录镜像系统并安装Docker软件,然后整体制作快照,即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像(经常更新的镜像):将软
发布应用 您可以将创建的应用发布到资产市场,供其他项目订阅和使用。 发布资产前,需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“应用”。 选择需要发布的应用,单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面,填写发布应用的相关信息。 表1 发布应用参数说明 参数 说明 名称
tag命令给待上传的镜像打标签。 执行镜像相关命令,请在本地搭建Docker环境,要求安装的容器引擎版本必须为1.11.2及以上。 默认标记到当前所在项目,需先使用切换项目命令进入想要上传镜像的项目。 命令结构 health docker tag <source-image-name:source-tag-name>
发布镜像 您可以将创建的镜像发布到资产市场,供其他项目订阅和使用。 发布资产前,需要先设置商标。详细可参考商标设置。 单击项目名称,进入项目管理页面,选择“镜像”页签。 单击需要发布的镜像名称,进入镜像详情页面。 单击“操作”列的“发布”。 图1 发布镜像 在发布页面,填写发布镜像的相关信息。
购买记录以及购买套餐包,也可以绑定CSS资源详细的购买步骤可以参考购买资源,此功能只支持专业版。 绑定CSS资源 使用自定义数据库之前需要先购买和绑定CSS资源,购买步骤参考购买资源,绑定具体操作如下: 在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。 单击“
发布数据 您可以将数据发布到资产市场,供其他项目订阅和使用。 发布资产前,需要先设置商标。详细可参考商标设置。 单击项目名称,进入项目管理页面,选择“数据”页签。 选择需要发布的数据或者文件夹,单击“操作”列的“更多>发布”。 图1 发布数据 在发布页面,填写发布数据的相关信息。
自定义数据库 盘古辅助制药平台支持用户自定义数据库,可以上传自己的数据构建自己的数据库,进行后续的分子搜索。构建自定义数据库需要先购买CSS资源和绑定CSS资源,详情见资源中心 自定义数据库 返回主页,单击“自定义数据库”进入界面,单击页面左上角的“创建数据库”,并填写相关信息。每个用户可新建100个自定义数据库。