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安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节操作指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本4.0.2a1为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
资源和成本规划 所需资源如表1所示,具体资源的实际费用请以对应官网价格显示为准。 表1 资源和成本规划 序号 资源 资源说明 获取路径 数量 费用 1 STAR-CCM+ 使用STAR-CCM+15.02版本。 建议从官方网站获取 1 以官网显示价格为准。 2 MPI(可选) Plateform
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本3.1.0rc2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI(X86 BMS场景) 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
安装和使用MPICH 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行MPICH应用(mpich-3.3.2版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装MPICH。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行社区OpenMPI(以4.0.2版本为例))。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 该任务指导用户在鲲鹏BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(以版本4.0.2a1为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。
创建应用集群 操作场景 您可以在几分钟之内,批量创建多台弹性云服务器。该任务指导用户使用制作的私有镜像创建应用集群,包括管理控制台方式和基于HTTPS请求的API(Application programming interface)方式。 管理控制台方式 登录管理控制台。 选择“计算
对于已完成HPC配置的弹性云服务器,您可以将其作为模板制作私有镜像,便于快速创建集群。该任务指导用户怎样将Linux弹性云服务器转化为私有镜像,包括管理控制台方式和基于HTTPS请求的API(Application programming interface)方式。 前提条件 已确保Linux云服务器网
为什么集群被删除后还在计费? 按需购买的集群删除时未勾选“删除云服务器”,因此只删除了集群信息,集群中的云服务器资源仍在继续扣费。 包周期类型的集群删除时只能删除集群信息,云服务器资源需要手动退订。 管理节点如使用购买EIP的选择,集群删除时,即使勾选了“删除云服务器”,绑定的E
执行以下命令,给密钥文件配置权限。 $ sudo chmod 600 id_rsa 执行以下命令,查询主机名。 # hostname 执行以下命令,添加本主机私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 示例: 192.168.0.1 ecs-ff-0001 执行以下命令,ssh方式登录本节点,验证是否可以不输入密码登录ECS。
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
配置BMS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的,例如LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。
执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,添加集群中所有主机的私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 添加的内容为集群中所有ECS的私网IP地址和主机名,例如: 192.168.0.1 ecs-ff-0001 192.168.0.2 ecs-ff-0002
在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群