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使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地，此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中，受网络影响可能出现损坏，下载命令默认会在下载完成后，验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性，以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health download
配合GenomeAgent(model='fromconfig')使用，配置模型的模型推理参数，预留参数接口，给需要调用的自部署模型用 # 请注意：您调用的第三方大模型API服务，其数据传输及处理可能涉及第三方服务器。本应用及平台不对第三方服务的内容、准确性、完整性及安全性承担任何责任。 # 请勿在使
如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。 例如，使用health switch project ngs-project命令进入到名为ngs-project的项目中。 使用命令行工具，用mkdir命令创建存储数据的文件夹。
submit命令引用本地的配置文件，启动分析作业。 命令结构 health create job [flags] # create和submit作用相同 health submit job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 是 本地的作业模板路
String 内存物理规格描述信息 netcard_detail String 网卡物理规格描述信息 cpu_arch String 裸金属服务器的CPU架构类型 gpu_info String GPU信息 请求示例 查询计算资源规格 /v1/{project_id}/system/
ID 无 是 流程id。 --workflow -w 否 本地workflow文件路径，可以是zip或nf文件。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表，用","分割，如"a,b,c"。 --main_file
以有项目所有者设置。 分享：关闭分享后，项目内数据不允许分享给其他项目，包括拷贝、引用两种方式。 下载：关闭下载后，项目内数据不允许下载至本地。 删除：关闭删除后，项目内数据不允许通过平台、命令行工具删除。 图1 数据保护策略 数据审计 平台通过云审计服务（CTS）提供操作记录的
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
获取作业模板 使用health get job -s命令获取启动分析作业的模板，复制并保存模板至本地，您可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台启动作业过程一致。模板修改好后，再使用命令行工具上传模板，启动分析作业。
数据管理命令 列举对象 显示当前目录 切换路径 文件拷贝 创建子目录 上传数据 清理本地记录的上传文件 下载数据 删除数据 数据导入 创建归档 获取归档数据 删除归档 恢复归档 获取数据归档列表 修改归档区域 获取数据作业 删除数据作业 重试数据作业 取消数据作业 移动对象 增量同步
<job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 job-id 不涉及 是 作业ID -- params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径 命令示例 health nextflow retry job f17a3542-3f7c-11eb-868a-fa163e3ddba1
下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据中心”页面下载数据至本地。 在“数据中心”页面，下载数据至本地。 选择待下载的数据，单击“操作”列“下载”即可。 或者单击“操作”列“下载为”，然后单击鼠标右键，选择“链接另存为”，下载数据。
模板名称，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板名称。 --description -d 否 描述，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板描述。 --yaml -y 是 本地模板yaml文件。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eih
其中vendor-config可简写为vc 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --name -n 否 供应商名称。 --logo -l 是 供应商图标本地路径。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
请将该模板保存为.yaml格式至本地，并在本地完成模板修改。例如，命名为ngs.yaml。 编写执行脚本并提交作业 运行分析作业时，流程中的每一个应用称之为一个任务（Task），通过循环读取Task的输入数据，可以实现作业的批量执行。 例如，您可以在本地创建.bat格式的批处理文件，执行该脚本即可批量运行NGS分析作业。
参数--log的优先级高于--file。如果命令中同时包含参数--log和--file，默认只执行--log。 --file -f 否 本地文件夹路径及自定义文件名称，下载详细数据作业执行日志到本地，需要与data-job-id一起使用。 --finish-from-time -x 否 查询提供时间之后的所有任务。例如，2006-01-02
pull镜像。 若该镜像没有lastest版本则需进入dockerhub官网进行查询。 查看镜像是否pull成功。 用docker images命令查看镜像是否pull成功。如果您本地已经有很多镜像，防止查询出全部镜像，可在docker images命令后面添加 | grep pegi3s使查询更精准。
ct为源项目名称，可选。不指定srcproject时，默认为当前项目。例如ngs:1.0:srcproject。 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。 --summary -s 否 流程的简要描述。 --description -d 否 流程的详细描述。 --output_dir
”、“\t”，除此之外您也可以使用其他分隔符。以图1为例，分隔符为制表符，创建数据库时，分隔符填写为“\t”，有效数据从第2行开始，跳过文件行数填写为1。 在本地编写.csv、.txt、.vcf文件时，文件编码格式使用UTF-8。 为保证查询性能，建议数据库行数小于500万行，若超过该量级，建议拆分数据库。
导入的模板，可以在“导入模板名称”中修改模板名称，单击“确定”。 图1 从其他项目导入模板 平台也提供了yaml格式的数据库模板，您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用，数据库模板支持yaml或yml格式，且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”，单击“下载示例文件”下
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