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入门 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成,各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 快速入门 关键概念 使用流程 初始化数据盘 什么是ECS
用户管理 作业清理配置 标签管理 消息中心管理 节点标签管理 医疗平台信息获取 性能加速资源管理 资源监控数据获取 存储资源查询 系统配置和供应商配置 系统配额及资源使用情况获取 父主题: API(医疗智能体平台)
OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需计费,计费详情请参考OBS流量费用中“公网流出流量 / 00:00-08:00(闲时)”和“公网流出流量 / 08:00-24:00(忙时)”。 父主题: 计费
在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”,其他参数可选填。参数填写完成后,单击“确定”,完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用,并使用鼠标拖拽至画布中。 将fastp的输出参数fq-file1、fa-file2和bwa-mem的输入参数fq-filefq-file2相连。
输入范围: 1.4-5,单位:Å。 名称:可修改,修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符;仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格;首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:运行一次功能会消耗一次。 单击“提交”。 提交成功后,可以在“作业中心”查看执行结果。
picard-insertsize算法拖拽到中间画布上。 图4 拖拽应用 设置输入、输出关系。 fastp的两个输出参数fq-file1和fq-file2是bwa-mem算法的输入参数,bwa-mem的sorted-bam参数是bamqc与picard-insertsize输入参数,参考图进行连接。
将签名信息添加到消息头,从而通过身份认证。 AK(Access Key ID):访问密钥ID。与私有访问密钥关联的唯一标识符;访问密钥ID和私有访问密钥一起使用,对请求进行加密签名。 SK(Secret Access Key):与访问密钥ID结合使用的密钥,对请求进行加密签名,可标识发送方,并防止请求被修改。
户, 用户组B里有50个用,两者之间有10个用户重复,那么同时选择用户组A和B,统计时显示已选择90个用户。 如果导入后用户状态显示异常,需联系技术支持处理。 单击“下一步”,设置角色。 角色:支持管理员和操作员两种角色,默认为操作员。权限描述可以参考表2。 用户资源配额:设置用
删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 单分子文件格式转换 创建分子或分子复合物批量下载任务 查询分子或分子复合物批量下载任务详情 受体预处理(Fasta格式)
优先级:运行优先级,分为0~9级,优先级高的作业会被优先执行。默认值为0。 计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用和作业都配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。
目时,才可以被移除。在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号和密码信息。在用户操作列,单击“安全设置”,重置用户的相关信息。 图3 重置用户信息 配额设置 您可以对用户管理中的某个用户设置配额。在用户操
destdir 无 是 目的路径。 --rename -e 否 重命名,上传文件时可选。 --recursive -r 否 递归上传文件夹中所有的文件和子文件夹,上传文件夹时必选。 --force -f 否 强制操作,不进行询问提示,上传文件夹时可选。 --flat -l 否 上传文件夹时,
--type -t 否 镜像类型,可选APP、NOTEBOOK或OTHER,不填写默认为OTHER。 --chip -c 否 芯片类型,只支持X86和ARM。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Windows health docker push
若确实存在路径需要包含多个文件或目录,可参考如下方案解决。 以下图为例,首先调整应用的输入参数为input-a和input-b,分别表示两个路径存在包含关系的目录(/test/sub和/test )。 然后修改应用的镜像启动命令如下即可。 cp -rf ${input-a} ${output};
基础通用类软件镜像,如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。
持小写字母、数字、中划线(-),开始只能是小写字母,结束只能是小写字母或数字。 描述 Notebook的简要描述。 镜像类型 支持系统镜像和自定义镜像。 工作环境 选择系统镜像时,工作环境选择“PY3”。 自定义镜像:当提供的镜像无法满足您的需求时,可以使用自己制作的Notebo
struct 否 表5 object 结构约束参数 quantiles 否 Array of numbers 属性约束类型minimize和maximize的参数 最小值:0.0 最大值:1.0 表5 StructureConstraintParams 参数 是否必选 参数类型 描述
StructureConstraintParams object 结构约束参数 quantiles 否 Array of numbers 属性约束类型minimize和maximize的参数 最小值:0.0 最大值:1.0 表5 StructureConstraintParams 参数 是否必选 参数类型 描述
购买套餐包的数量。取值范围:1-50。 购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月,最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。 如果支付时间晚于指定生效时间,资源包将在支付后立即生效。 图2 购买套餐包 设置完成后,单击“立即购买”,然后单击“确认”。
and types of the app's input and output parameters. 请检查是否改变了该应用输入和输出参数的数量和类型,或者删除所有使用到该应用的流程。 400 eihealth.01050013 The app is used by workflow