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分子生成基于盘古药物分子大模型，对初始数据集进行采样，多目标、多方向的快速生成新颖且与靶点蛋白亲和力高的化合物。 单击“分子生成”功能卡片，进入配置页面。 输入初始数据集，有两种输入方式： 选择文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件；小分子支持10-10000个。如果没有初始数据集，可以选择官方库，ZINC数据集。
上传数据 NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。
JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图1 Terminal 例如，您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图2 执行命令 父主题： Notebook
GRch38-reference数据集为人类基因参考基因组，广泛用于人类基因组分析中，如WGS、callvariants 等。数据集总大小约 13GB。 NGS大数据集 NA24385-raw数据集为NGS流程测试数据集，作为该流程的原始输入。数据集总大小约 186.2GB。 NGS小数据集 NA12
模型搜索阶段，根据json文件中的配置参数，对于选定的模型参数会训练一定步数，搜索得到较好结果的参数进行后续训练。训练过程中可选择在验证数据集上进行评估，评估结果更好的模型参数将会保留。 提取降维之后数据：完成模型训练后，生成降维后的结果数据。 当您在运行AutoGenome示例出现“Warning：restart
输入的参考基因组序列，已经通过bwa构建了index。 依赖 Variant Sets GATK4在做Variant Calling阶段需要输入的参考Variants数据集。 输出 FastQC Report 原始测序数据的质控报告，以HTML文件形式展示。 输出 BamQC Report 测序比对数据的质量控制报告，以HTML文件的形式展示。
的数据。数据上传方法请参见上传数据。 若没有，可以先订阅资产市场里的示例数据进行分析，这里先用资产市场中的“人类基因组数据”和“NGS小数据集”进行分析。 图3 订阅数据 可以在“数据”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图4 查看订阅的数据 步骤3：启动作业 在流程页面，单击“启动作
应用描述 取值范围[0,65535]，后续支持markdown文本 labels: # 应用标签 取值范围[0,5]，标签名称长度为1~32，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。
卸载Nextflow 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“卸载”。 图3 卸载Nextflow 在弹出的对话框中输入“yes”，单击“确定”。 父主题： Nextflow
JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图5 Terminal 例如，您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图6 执行命令 父主题： 开发环境（Notebook）
流程描述 取值范围[0,65535]，后续支持markdown文本 labels: # 流程标签，取值范围[0,5]，标签名称长度为1~32，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。
None 医学文本标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行数据管理和标注 07:08 医学文本管理和标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行团队标注 05:44 医学文本团队标注 药物虚拟筛选 医疗智能体 EIHealth 药物虚拟筛选
应用描述 取值范围[0,65535]，后续支持markdown文本 labels: # 应用标签 取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。
取值范围[0,65535]，后续支持markdown文本 labels: # 流程标签，取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。
应用描述 取值范围[0,65535]，后续支持markdown文本 最小长度：0 最大长度：65535 labels 否 Array of strings 应用标签 取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。
应用描述 取值范围[0,65535]，后续支持markdown文本 最小长度：0 最大长度：65535 labels 否 Array of strings 应用标签 取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。
列“更多>取消”，取消对应的作业。 重试 对于状态为“失败”或者“已取消”的作业，可以选择重试。单击对应作业操作列“更多>重试”，根据提示对话框，选择“立即重试”或者“更改参数”。 如果选择“更改参数”，系统会跳转至作业参数配置页面，进行修改后，单击“重试作业”。 搜索 普通搜索
type error. 更改输入文本为字符串类型。 400 eihealth.03011002 Input key error. 更改关键字为“text”。 400 eihealth.03011003 Text length error. 输入文本长度需在1-256之间。 401
GenerationResultItem objects 分子生成结果条目 initial_dataset_size Integer 初始化数据集的分子条目数 strong_constraints Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints
流程描述 取值范围[0,65535]，后续支持markdown文本 最小长度：0 最大长度：65535 labels 否 Array of strings 流程标签，取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。
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