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请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 创建药物作业基本信息。 smiles 是 String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512 params 是 SynthesisParamDto
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 作业基本信息。 file 是 ClusteringDrugFile object 分子文件。 表4 CreateDrugJobBasicInfo 参数
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String 作业id 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String
镜像版本不存在 上传镜像数量超出配额 待上传项目不存在 对于--description 参数,当描述中带有空格时,需要添加引号来获取完整的描述信息。 父主题: 镜像管理命令
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 创建药物作业基本信息。 molecule_file 是 MoleculeFileDto object 分子文件。 base_model_id 否 String
列举路径中的对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时,需要使用“路径/文件名”或“路径\文件名”格式。请依据操作系统的路径规范使用,如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如()之类的,运行的时候需要将整个路径用""括起来,或者用\将字符转义,例如:health
参数类型 描述 name 是 String 自定义属性名称 最小长度:1 最大长度:32 description 否 String 自定义属性描述信息 最小长度:0 最大长度:256 type 是 String 属性预测类型 枚举值: binary numerical smiles 是 Array
的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用,并将其编排调度,形成自定义分析流程。 同时集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。
在“资产市场”中查找“autogenome”镜像。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅该镜像。 订阅的镜像将显示在“项目管理 > 镜像”页面的镜像列表中。 步骤2:创建Notebook 在“项目管理 > 开发”页面,单击“创建Notebook”,参考表 参数说明填写信息。 表1 参数说明
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 创建药物作业基本信息。 receptors 是 Array of CpiReceptor objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 100 ligands
String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 表9 object 属性定义的元信息 表9 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128
Array of AppInputParameterDto objects 应用的输入参数信息 outputs Array of AppOutputParameterDto objects 应用的输出参数信息 create_time String 创建应用时间 update_time String
blood–brain barrier Penetration,血脑屏障。作用于中枢神经系统的药物需要穿过血脑屏障 (BBB) 才能达到其分子靶点。相反,对于具有外围靶点的药物,不需要BBB渗透以避免中枢神经系统副作用,单位为cm/s。logBB 大于-1为(BBB+), logBB小于等
查看药筛作业和结果下载 查看作业进程 用户可以在“项目 > 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”,获取输出结果的路径。 文件的命名方式为:蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2
自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否 PropDefinition object 属性定义的元信息 表9 PropDefinition 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128
地实现各自的商业价值。 订阅资产 资产市场提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。您可以查看各类资产的详细介绍和使用方法,并订阅资产至项目中使用。 单击所需的资产名称,查看资产的详细信息。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅资产。 图1 订阅资产 订阅的资产将显示在您的项目中。对于
在配置文件中通过recordMaxLogSize和recordBackups分别配置。 当涉及多文件/文件夹时,如需确认失败任务的具体错误信息,可参考结果清单文件夹下的失败结果清单文件“rm_failed_report_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 作业基本信息。 receptor 是 ReceptorDrugFile object 受体文件。 ligand 是 ProbeDrugFile object