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real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。 upstream_job_info String 上游作业信息。 表5 Progress 参数 参数类型 描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time
自动作业使用的IO加速实例id,不填表示不使用 最小长度:0 最大长度:128 tasks 否 Array of JobTaskDto objects 自动作业依赖的流程信息 数组长度:0 - 64 表4 DatabaseTriggerDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 触发器的列名,取值范围:[1
Unknown image NotebookImage object notebook镜像信息 storages Array of NotebookStorage objects notebook存储信息 create_time String notebook创建时间 update_time
Unknown image NotebookImage object notebook镜像信息 storages Array of NotebookStorage objects notebook存储信息 create_time String notebook创建时间 update_time
参数类型 描述 description 否 String 描述信息,取值范围[0,1024] 最小长度:0 最大长度:1024 storages 是 Array of NotebookStorage objects 挂载信息 数组长度:1 - 6 flavor 是 FlavorInfo
notebook命令 创建notebook 获取notebook信息 删除notebook 编辑notebook 启动notebook 停止notebook
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
登录盘古辅助制药平台,选择“AI模型”。 图1 AI模型 单击“创建模型”,设置相关参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 模型名称。 长度为5-32个字符,首位需以英文字母开头,仅可以使用字母、数字、下划线“_”和中划线“-”和空格。 描述 设置模型的描述信息。 基模型 设置基模型,基模型与分子描述符有关。选择不同的基模型,分子描述符不一样。
Nextflow作业管理命令 启动作业 查询作业 删除指定作业 重试作业 停止作业 获取任务信息
QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。 查看作业信息 点击作业的“作业信息”页面可以查看作业的运行时间和配置参数。 图14 查看作业信息 聚类分析 目前分子对接返回的结果小分子数较多,无法进行批量分析,通过一些聚类的 辅助方式能更好
准备工作 购买服务 购买存储套餐包 购买系统资源 获取认证信息 父主题: 用户指南(基因平台)
String 作业创建时间 finish_time String 作业完成时间 failed_message String 作业运行失败描述信息,当作业执行失败时会返回 failed_reason String 作业运行失败原因,当作业执行失败时会返回 workflow_name String
配置命令行工具 步骤1:获取认证信息 步骤2:获取命令行工具 步骤3:初始化配置
docker images [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --name -n 否 查询指定镜像名下的所有tag信息,支持模糊查找。 --type -t 否 查询某个类型的镜像,可选APP、NOTEBOOK、OTHER。 --project 无 否 指定
第1部分描述了蛋白质与配体小分子的结合能大小,以及该蛋白质在所有配体小分子的对接结果的均值和标准差。 第2部分描述了配体小分子信息,注释结果如下。 分类:该小分子的在DrugBank中分类信息。 化学式:小分子的化学式。 XLOGP3:小分子的脂溶性logP。 TPSA:小分子的拓扑极性表面积。 靶点:小分子的靶点。
来源模板id creator String 创建者 columns Array of DatabaseColumnDto objects 数据库列信息列表 create_time String 创建时间 primary_key String 主键 is_prefab Boolean 是否是预置模板
数据作业管理 获取数据作业列表 获取数据作业详细信息 删除数据作业 取消数据作业 重试数据作业 获取数据作业执行日志 下载数据作业执行日志 父主题: 数据管理
传学修饰等重要的生物学问题。 本示例中NGS流程基于医疗智能体(EIHealth)平台搭建,流程以fastq格式数据作为输入,对碱基的质量信息进行评估,判断可靠程度,通过质控、比对、变异检测等步骤,最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤,涵盖
以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing.html 对于pod配置,暂不支持用户侧设置。若用户侧设置的情况下可能会导致对应Process执行失败。相关信息可参考https://www.nextflow
来源模板id creator String 创建者 columns Array of DatabaseColumnDto objects 数据库列信息列表 create_time String 创建时间 primary_key String 主键 is_prefab Boolean 是否是预置模板