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查看作业信息 聚类分析 目前靶点口袋分子设计返回的结果小分子数较多,无法进行批量分析,通过一些聚类的辅助方式能更好的选择分子。从每个类里挑选出一两个分子进行后续分析和验证,提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架,来进行下游的分子优化、合成路径规划等。 在输出结果页面
summary: 'summary' # 应用简述 取值范围[0,128] description: 'description' # 应用描述 取值范围[0,65535],后续支持markdown文本 labels:
conda activate py37 生成Notebook kernel。 conda install -n py37 ipykernel python -m ipykernel install --user --name py37 --display-name "conda_py37"
"custom_prop_name", "type" : "numerical", "description" : "custom_prop_description" } } ] } 响应示例 状态码: 201 分子生成任务成功提交响应,返回分子生成任务ID
"custom_prop_name", "type" : "numerical", "description" : "custom_prop_description" } } ] } 响应示例 状态码: 201 CPI成功提交响应,返回CPI任务ID "
示。 表1 下载列表 支持平台 下载地址 Windows 64位 health-windows-x86_64.zip、health-windows-x86_64.zip.sha256 Linux ARM 64位 health-linux-aarch64.tar、health-linux-aarch64
访问密钥)。 区域(Region) 从地理位置和网络时延维度划分,同一个Region内共享弹性计算、块存储、对象存储、VPC网络、弹性公网IP、镜像等公共服务。Region分为通用Region和专属Region,通用Region指面向公共租户提供通用云服务的Region;专属Re
AutoGenome示例 示例名称 说明 single_cell_rfcn_densenet.ipynb 基于RFCN-DenseNet和表达谱对单细胞发育时期进行分类。 pbmc_res_vae.ipynb 基于Res-VAE和表达谱对单细胞数据降维。 步骤4:使用AutoGenome
保持唯一 summary: xxx # 可选 # 短描述 description: 'description' # 可选 # 完整描述文本 labels:
String 内存物理规格描述信息 netcard_detail String 网卡物理规格描述信息 cpu_arch String 裸金属服务器的CPU架构类型 gpu_info String GPU信息 请求示例 查询计算资源规格 /v1/{project_id}/system/
缺省值:1 total_part 否 Integer 分段总数,上传的文件总共分成了几个片段 最小值:1 最大值:128 缺省值:1 multipart_id 否 String 分段上传任务id,除了第一个片段外,后续的片段都需要标识出任务id 最小长度:1 最大长度:128 file_name
"custom_prop_name", "type" : "numerical", "description" : "custom_prop_description" } } ] } 响应示例 状态码: 201 分子优化任务成功提交响应,返回分子优化任务ID
"description": "" }, { "name": "in-str", "pattern": "", "type": "STRING", "required": true, "description":
"custom_prop_name", "type" : "numerical", "description" : "custom_prop_description" } } ], "prop_names" : [ "formula", "ab"
待删除对象的版本号。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果和失败结果两个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_output。 结果清单文件命名规则:rm_{succeed |
物研究和临床试验提供方向。 药物筛选通常分为靶点蛋白确定、候选药物小分子筛选、试验验证、临床验证四大阶段。 计算机辅助技术可以极快地加速前两个阶段,利用同源建模和分子动力学模拟,从病毒蛋白一级序列快速获得病毒蛋白3D结构,并且依托云端算力实现大规模筛选和成药性分析,从万级的小分子
LigandSimilarityGraphTaskResultPairDto 参数 参数类型 描述 ligands Array of strings 两个配体名称。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:2 - 2 success Boolean 相似度计算是否成功。 similarity
您也可以添加路径或者重置路径。添加路径和重置路径可以通过单击右边的“添加路径”或者“重置”进行操作。添加路径也可以在左侧微扰图中直接通过两个分子之间进行连线添加。可以在微扰图中单击某条待计算路径上的,删除该条待计算路径。 图2 添加或者删除待计算路径 图3 选择配体对 返回相似
以看到优化后的小分子与靶点的结合构象。 如果上传了双靶点,可以通过切换来切换靶点,查看相应靶点和优化后分子的结合构象。如果设置了两个靶点会默认下载两个靶点的结果。 图14 查看3D图 在查看3D的页面中,单击右侧的配体列表中,每个配体卡片右上角的,可以查看 查看详情:可以查看每个
批量删除分段上传任务时该参数可选。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果和失败结果两个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_output。 结果清单文件命名规则:abort_{succeed