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功能模块 靶点发现 苗头化合物发现 先导化合物优化 通用工具 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
CSS集群管理 绑定CSS集群 获取CSS集群列表 获取最终租户CSS集群列表 测试CSS集群连接 CSS集群解绑 父主题： API（盘古辅助制药平台）
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题： 系统管理
数据管理 数据管理简介 添加数据 发布数据 数据管理常用操作 归档数据 数据控制与数据审计 命令行工具概述 父主题： 用户指南（基因平台）
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
选择安装位置，按“Enter”。 安装完成后，输入“yes”。 初始化Anaconda配置并测试安装。 执行以下命令初始化Anaconda配置。 export PATH=~/anaconda3/bin:$PATH source ~/.bashrc 测试安装。 conda -V 查看当前环境列表，并创建新环境参数。
--help可以替换成任何fastqc的命令，与linux类似。 步骤2：上传镜像至EIHealth平台 配置命令行工具。 若已完成配置，可跳过此步骤。 在命令行工具所在的目录，使用switch命令进入EIHelath平台的项目中。 # 命令结构 health switch project
定义分析流程。 准备工作 1. 购买服务 2. 获取认证信息 3. 下载命令行工具 4. 命令行工具初始化 用户管理 1. 创建子用户 2. 添加项目成员和权限 数据管理 数据管理常用操作 命令行工具概述 镜像、应用、流程、作业 1. 制作镜像 2. 创建应用 3. 搭建流程 4
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台
fastqc 对测序得到的fastq数据进行质控。 trimmomatic 使用trimmomatic工具去掉测序接头，得到去接头后fastq格式的reads。 star 使用STAR比对工具将去接头后的reads比对到参考基因组，得到bam文件和多种格式的统计报告。 使用RNA-Seq流程的详细步骤如下所示：
搭建NGS流程 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 流程”页签，单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”，其他参数可选填。参数填写完成后，单击“确定”，完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用，并使用鼠标拖拽至画布中。
在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。 单击“绑定”进入绑定界面，选择要绑定的CSS集群名称、填写管理员账户名和管理员密码。 单击“测试链接”验证用户名或密码无误后单击“确定”，即可完成绑定（可选项）。您也可以单击操作列的“解除绑定”来解除当前的绑定。 图1 绑定CSS资源入口
进入资产市场，分别订阅fasp，bwa-mem，bamqc，picard-insertsize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。 图2 查看订阅的应用 步骤2：新建流程 在“工具 > 流程”页面，单击“新建流程”按钮，填写流程名称，版本等信息。 图3 新建流程 利用拖拽的
"labels" : [ { "id" : "id", "name" : "label1", "description" : "测试标签", "creator" : "user1", "create_time" : "2021-02-01T14:25:34Z"
具有高性能、模块化等特性，是一个完全自主研发的分子模拟软件库。基于高毅勤教授课题组和华为团队的技术支持，已经实现自由能微扰加速10倍以上。测试 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 展开数据文件夹，选择待下载的数据。 单击“操作”列“下载”。 单击鼠标右键，选择“链接另存为”，下载数据。 图6 下载数据
是-2^1024 ~ +2^1024，也即-1.79E+308 ~ +1.79E+308。超出精度返回会保留小数点后16位的精度。 图1 测试数据 图2 创建数据库 导入数据 数据库创建好以后，您可以参照数据库模板格式，将已有的数据进行导入。 单击数据库右上角“导入数据”。 图3
节约研发成本。 产品优势 提供开放的、易于扩展的平台架构。 提供端到端的AI赋能平台加速AI的研发和应用。 提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产，提升企业的效率。 内置大量生物医疗领域标准分析流程，并结合华为特有的高性能云计算，多样性算力，大数据等技术加速计算过程。
单击“操作”列的“删除”，删除数据。 图4 删除数据 批量删除 勾选文件名左侧图标，单击“删除”，删除数据。 图5 批量删除 查看3D 支持以Mol 3D Viewer工具查看蛋白质和小分子的3D结构。 父主题： 数据管理
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