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弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以4.0.2版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi-4
安装和使用Intel MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Intel MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel
03r-ce.bin 安装Platform MPI。 # ./platform_mpi-09.01.04.03r-ce.bin 根据系统提示安装Platform MPI,默认安装到“/opt/ibm/platform_mpi”文件夹下。 图1 Platform MPI成功安装 配置环境变量。
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
如果选择手动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export IBM_SPECTRUM_MPI_LICENSE_ACCEPT=no 安装License部分。 选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议的,执行以下命令: # rpm -ivh
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节操作指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本4.0.2a1为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本3.1.0rc2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
安装和使用MPI 弹性云服务器场景支持使用的MPI IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
系统不会定期自动修改弹性云服务器密码。为安全起见,建议您定期修改密码。 高级配置 可选配置,如需使用“高级配置”中的功能,请单击“现在配置”。否则,请单击“暂不配置”。 文件注入 可选配置,主要用于创建弹性云服务器时向弹性云服务器注入脚本文件或其他文件。配置文件注入后,系统在创建弹性云服务器时自动将文件注入到指定目录下。
HPC-S²与其他服务的关系 服务名称 HPC-S²与其他服务的关系 主要交互功能 弹性云服务器(ECS) 购买弹性云服务器创建HPC集群或使用已有弹性云服务器部署HPC集群。 自定义购买ECS 虚拟私有云(VPC) 同一个HPC场景的云服务器,都位于同一个VPC中,并且需要使用VPC中的子网和安全组进行相关的网络安全隔离。
配置单个ECS免密登录 操作场景 该任务指导用户在单个弹性云服务器内执行相关配置,使其可以免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。
ense.sh 执行以下命令,安装软件部分。 # rpm -ivh ibm_smpi-10.1.0.3eval_170901-rh7_Apr11.x86_64.rpm 图2 安装软件 配置MPI环境变量。 默认情况下,Spectrum MPI会安装至“/opt/ibm/spect
执行以下命令,给密钥文件配置权限。 $ sudo chmod 600 id_rsa 执行以下命令,ssh方式登录本节点,验证是否可以不输入密码登录BMS。 $ ssh localhost 图1 免密登录BMS 系统回显结果如图1所示,可以无密钥登录本节点,表示权限配置成功。 依次登录集群中其他BMS,重复执行步骤1~5。
按照提示输入Enter或1(accept the agreement)直到安装完成,以下为安装成功界面。 图1 Platform MPI安装成功 默认安装路径为/opt/ibm/platform_mpi。 配置MPI环境变量。 执行以下命令,获取pkey。 # cat /sys/c
Intel MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Intel MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel MPI。 下载地址:https://software.intel
--with-mxm=/opt/hpcx-v2.0.0/mxm # make all install 图1 安装OpenMPI 系统回显的安装过程如图1所示,且退出后无报错,说明安装OpenMPI成功。 配置MPI环境变量。 在“~/.bashrc”添加如下环境变量: export PATH=$P
安装和使用MPI(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform
据Mellanox提供的操作指导进行安装。 以操作系统CentOS 7.3为例,推荐安装4.2.1版本的安装包,下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0.0-rhel7.3-x86_64.tgz”,并执行以下命令进行安装: # yum install tk tcl
社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI