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社区OpenMPI - 高性能计算 HPC
执行以下命令,在单个弹性云服务器上运行Intel MPI benchmark。
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配置ECS集群互相免密登录 - 高性能计算 HPC
假设集群中有2个弹性云服务器,另一个云服务器的主机名为hostname2,则命令行为: $ ssh 用户名@SERVER_IP $ ssh hostname2 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
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实施步骤 - 高性能计算 HPC
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
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安装和使用MPI(X86 BMS场景) - 高性能计算 HPC
裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
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基于STAR-CCM+部署HPC集群 - 高性能计算 HPC
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
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Spectrum MPI - 高性能计算 HPC
将1中下载的HPC-X压缩包上传至运行MPI的弹性云服务器内。 执行以下命令,解压HPC-X工具套件。
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IB驱动自带的OpenMPI - 高性能计算 HPC
前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。
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主要概念 - 高性能计算 HPC
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
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方案概述 - 高性能计算 HPC
优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的版本需要提前适配RoCE,请联系技术支持进行操作,建议使用推荐版本运行STAR-CCM+。
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在HPC集群上运行MPI应用 - 高性能计算 HPC
在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
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常见问题 - 高性能计算 HPC
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
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资源和成本规划 - 高性能计算 HPC
仿真软件STAR-CCM+安装在SFS Turbo中,其他软件安装在弹性云服务器中。 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
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安装和使用MPICH - 高性能计算 HPC
安装和使用MPICH 操作场景 本节指导用户在鲲鹏BMS集群上安装和使用MPICH应用(以版本mpich-3.3.2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装MPICH。 下载MPICH。 下载地址:https:
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RDMA - 高性能计算 HPC
远程存储器将被读取,无需任何干预的远程进程(或处理器)。远程CPU中的缓存将不会被访问的内存内容填满。 基于消息的事务:数据被作为离散消息处理,而不是作为流,这消除了应用将流分成不同消息/事务的需要。
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通讯录安装 - 高性能计算 HPC
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
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在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) - 高性能计算 HPC
IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
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配置节点互信 - 高性能计算 HPC
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如
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安装和使用社区OpenMPI - 高性能计算 HPC
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以4.0.2版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi
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RoCE - 高性能计算 HPC
RoCE RoCE概念 RDMA over Converged Ethernet (RoCE)是一种网络协议,允许应用通过以太网实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本,v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v2
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挂载共享目录 - 高性能计算 HPC
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt