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径样式为:path/;引用数据时目的存放路径为本项目的根目录,故无需指定destdir。 --md5s -m 否 网络下载链接对应的md5列表,值用; 分隔,和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
位为GB。 CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型,以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如,GATK是基于X86指令集开发的生信软件,使用CentOS的X86系统创建GATK镜像,则在创建应用时选择“X86”。 CPU需求:请按实际需求填写,取值范围为“0
下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
、“短描述”和“描述”。 “流程名称”和“版本”为必填项,其他参数可选填。 图2 流程参数 填写“超时时间”、“输出路径”。 为可选参数,基于流程创建分析作业时,该参数可重新定义。 “超时时间”指作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。
描述 source 是 String 模型数据文件来源。 枚举值: public private url 是 String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id 否 String
描述 source 是 String 数据库文件来源。 枚举值: public private url 是 String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id 否 String
k数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 用户在Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的当前项目OBS路径下的内容操作,暂不支持引用的项目数据路径。 参数填写无误后,单击“立即创建”,创建Notebook。 步骤3:进
参数类型 描述 source String 数据库文件来源。 枚举值: public private url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id String 数
选择。如果作业加速类型选择IO加速或者本地盘加速,则此处task加速类型无法设置。 参数确认无误后,单击页面上方“启动作业”按钮,可以直接基于该流程创建自动分析作业。 查看作业运行结果 自动作业运行完成后,在自动作业列表中单击数据表名称,跳转至对应的数据表中。在设置的状态更新列中
ARCHIVE_DATA_DELETE 删除归档数据。删除归档数据时给予消息提示,删除结果给予消息提示。 IMPORT_NETWORK_DATA 导入网络数据。导入网络数据时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 SUBSCRIBE_DATA 订阅数据。订阅数据时给予消息提示,订阅结果给予消息提示。 DATABASE_IMPORT
令行工具中,该过程以配置文件的形式给出,对于由多个应用搭建出来的流程,命令行工具中通过指定不同应用间的输入输出关系,完成应用的连接。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建流程,创建好的流程将同步显示到EIHealth平台。 获取流程模板 使用health get workflow
参数类型 描述 source String 模型数据文件来源。 枚举值: public private url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id String 模
进入医疗智能体“总览”页面,单击“EIHealth”。 图3 购买EIHealth平台 根据实际需求选择计费方式。 图4 选择计费方式 区域:请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。不同区域云服务产品之间内网互不相通。 平台规格:选择“基因平台”或“药物平台”。 平台计费方式:选择“包年包月”或“按需”计费。
在该目录中创建一个空白文件abc.txt,创建一个webapp目录。 touch abc.txt mkdir webapp 在该目录中下载一个网络图片。 wget https://www.baidu.com/img/bd_logo1.png 执行vi Dockerfile命令,进入Dockerfile文件中,编写文件。
使用命令行工具下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
该命令不支持将数据上传到引用目录。 最小可以上传0Byte的空文件或文件夹,最大可以上传48.8TB的单个文件。 数据在上传的过程中,受网络影响可能出现损坏,上传命令默认会在上传完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
是 String 作业依赖的组件类型,仅支持填写workflow tasks 否 Array of JobTaskDto objects 基于替换规则压扁后,job实际的运行信息 数组长度:0 - 64 io_acc_id 否 String 作业使用的IO加速实例id,不填表示不使用
tool_info ToolInfoDto object 流程信息 tasks Array of TaskDefinitionDto objects 基于替换规则压扁后的效果,即job运行的实际配置 task_runtime_info Array of TaskRuntimeDto objects
否 复制单个对象时可指定的源对象版本号。 --acl -a 否 复制对象时可指定的目标对象的预定义访问策略。 支持的值: private:私有读写 public-read:公共读 public-read-write:公共读写 bucket-owner-full-control:桶拥有者完全控制
sionId选项。 移动对象时该参数可选。 --acl -a 否 移动对象时可指定的目标对象的预定义访问策略。支持的值: private:私有读写 public-read:公共读 public-read-write:公共读写 bucket-owner-full-control:桶拥有者完全控制