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登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 流程”页签,单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”,其他参数可选填。参数填写完成后,单击“确定”,完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用,并使用鼠标拖拽至画布中。 将fastp的输出
项目管理员具备除了删除、冻结、转移、解冻、恢复外其他的完整项目权限。 开发者 项目开发者可在项目内执行完整的操作,如Notebook、流程管理等,但无项目分享等权限。 上传者 项目数据上传者,可通过EIHealth平台或命令行工具上传数据。无法执行流程和Notebook等操作。 观看者 项目查看人员仅具备项目查看权限,无项目操作权限。
使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health download
finish_time String 作业结束时间 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回 failed_reason String 失败原因,当作业执行失败时会返回 user_name String 创建任务的用户名称 tool_info ToolInfoDto
作业的详细描述信息。 --labels -l 否 作业标签列表。以","分隔,如:"a,b"。 --add-command -a 否 作业额外执行的命令,如:--param1 hello。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 --priority -o
5],不能包含中文字符 commands: # docker启动时执行命令 单行命令长度取值范围[0-256],不能包含中文字符,支持多行输入,最多支持300行。 - 'echo eihealth;'
由浅入深,带您玩转EIHealth 01 了解 医疗智能体(EIHealth)面向基因组分析、药物研发、临床研究三个领域,提供专业的AI研发平台,让科研过程标准化、可执行。 产品介绍 什么是医疗智能体 应用场景 AI医疗影像 AI药物研究 AI基因组研究 03 入门 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开
finish_time String 作业结束时间 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回 failed_reason String 失败原因,当作业执行失败时会返回 user_name String 创建任务的用户名称 workflow_name String
tebook:cuda11.0-custom-v1.0.8 在基础镜像中,为您内置了CUDA11.0环境。使用CUDA11.0环境前,需要执行以下命令导入环境变量。 export PATH=$PATH:/usr/local/nvidia/bin export LD_LIBRARY
strings 自动作业标签 priority Integer 自动作业优先级,[0,9],0表示最低,默认0 timeout Integer 作业执行超时时长,取值范围: [1, 144000],单位:分钟,默认数值1440 最小值:1 最大值:144000 status String 自动作业状态
位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:运行一次功能会消耗一次。 单击“提交”。 提交成功后,可以在“作业中心”查看执行结果。 图1 设置靶点口袋发现文件 查看靶点口袋发现结果。 单击作业名称,在输出结果页面,可以单击“查看轨迹”,下载运动轨迹。可以单击”下
olkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health get message --limit 5 # 执行成功返回结果如下 Resource Name Resource Type Message Type Project Name
件,随意调整文件展示位置,可以同时打开多个文件。 图8 多文件任意编排 当在一个Notebook中写代码时,如果需要实时同步编辑文件并查看执行结果,可以新建该文件的多个视图。 打开此文件,然后单击菜单栏“File>New View for Notebook”,即可打开多个视图。 图9
参数类型 描述 job_quota Integer 允许同时运行的作业数 最小值:1 最大值:100 job_timeout Integer 作业执行超时时长,单位天 最小值:1 最大值:60 cpu_quota Integer 作业的CPU资源配额,单位核 最小值:1 最大值:1024
complete_data Array of strings 已完成的数据列表 running_data Array of strings 正在执行的数据列表 creator String 数据作业创建者 source_project_id String 非本项目操作场景下源项目名称 source_project_name
OBSFS:obsfs-buckt-name:/path1/ # 返回结果如下 reference data successfully! 执行上述三个命令成功后,项目根目录层级显示如下: ├─lmx-test-project # 本项目名称 │ ├─path1
JobEventRsp objects 作业事件列表 表4 JobEventRsp 参数 参数类型 描述 action_name String 执行动作名称 count Integer 作业启动事件发生次数 first_timestamp String 作业启动事件首次上报时间 last_timestamp
String 作业完成时间 failed_message String 作业运行失败描述信息,当作业执行失败时会返回 failed_reason String 作业运行失败原因,当作业执行失败时会返回 tool_info ToolInfoDto object 流程信息 tasks Array
是否必选 参数类型 描述 asset_id 是 String 资产ID 最小长度:1 最大长度:128 overwrite 否 Boolean 执行策略(true:全部覆盖,false:全部跳过,默认为true) 缺省值:true target_folder 否 String 目标文件夹
job_quota 是 Integer 允许同时运行的作业数 最小值:1 最大值:100 job_timeout 是 Integer 作业执行超时时长,单位天 最小值:1 最大值:60 cpu_quota 是 Integer 作业的CPU资源配额,单位核 最小值:1 最大值:1024