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reference data successfully! 从外部桶中引用数据 health import data OBS:obs-buckt-name:/path1/ # 返回结果如下 reference data successfully! 从外部并行文件系统中引用数据 health import
评估测序的Reads数目，测序Base数，测序深度等。 低质量Reads过滤 过滤低质量的测序Reads，得到Clean Reads。 基因组比对 将Clean Reads比对到参考基因组上，同时输出比对率、深度、覆盖度的统计信息。 基因组变异检测 基于上述比对得到的bam文件，通过GATK4做Variant Calling，输出变异检测结果。
都要求您从请求消息中单独传递它，所以在此单独强调。 表1 请求URI 参数 说明 URI-scheme 传输请求的协议，当前所有API均采用HTTPS协议。 Endpoint 承载REST服务端点的服务器域名或IP，不同服务在不同区域时，对应Endpoint不同，可以从终端节点中获取。
平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
归档数据 功能介绍 将需要归档的重要数据拷贝到数据归档桶 调试 您可以在API Explorer中调试该接口，支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例，并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth
那么超出部分的作业会按照投递时间顺序，从最新投递的向前执行，不会按照优先级进行运行。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。
删除：运行中的任务不支持删除，只可删除运行结束的数据。 重试：可对执行失败的任务从失败位置进行重试。 图1 数据作业 复制数据 在“数据”页面，使用“复制”，将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击“复制”。 图2 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹，以及数据存储路径，单击“确认”，复制数据。
那么超出部分的作业会按照投递时间顺序，从最新投递的向前执行，不会按照优先级进行运行。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。
那么超出部分的作业会按照投递时间顺序，从最新投递的向前执行，不会按照优先级进行运行。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。
下载EIHealth平台bucket-test项目中src/abc.txt文件到本地的data路径中。 health download /src/abc.txt D:\local\data 下载项目中的abc.txt文件到本地，重命名为abc1.txt。 health download /src/abc
批量执行NGS分析 对于测序得到的大量数据，批量并自动执行NGS分析是提高工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出，图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验，但是当面临大批量的测序数据时，需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节
--dryRun -y 否 测试模式运行，不执行实际的复制操作。 --crr -c 否 复制时使用客户端跨区域复制模式，以通过数据流的方式从源桶直接复制数据到目标桶，且两个桶可以是任意两个OBS服务的桶。 若设置了该参数，必须确保更新了配置文件中客户端跨区域复制的相关配置信息，具体可参考
步骤3：进入jupyterlab环境使用genomeagent智能体框架 步骤1：订阅镜像 使用genomeagent镜像前，需要您在资产市场中订阅该镜像到项目中。 登录医疗智能体，进入基因平台。 在“资产市场”中查找“genomeagent”镜像。 单击界面右侧“订阅”图标，订阅该镜像。 订阅的镜像将显示在“项目管理
-H 是 增量同步类型：copy/download/upload。 --crr -c 否 复制时使用客户端跨区域复制模式，从通过数据流的方式从源桶直接复制数据到目标桶，且两个桶可以是任意两个OBS服务的桶。 若设置了该参数，必须确保更新了配置文件中客户端跨区域复制的相关配置信息，具
样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。一般包括从环境样品中提取基因组DNA, 进行高通量测序分析，或克隆DNA到合适的载体，导入宿主菌体，筛选目的转化子等工作。 该流程主要基于Kraken2构建，跟进数据库进行物种注释。
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