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and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 Insert Size Estimation 针对构建Index后的bam文件，统计测序数据的Insert size的分布。 Bam QC 评估比对得到的bam文件的质量。 GATK MarkDuplicates
EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook，可为您提供在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook的详细操作指导，请参见Jupyter Notebook使用文档。
最大长度：24 响应参数 状态码： 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 流程id 请求示例 订阅流程，订阅后流程的名称为dest_workflow_name，版本为1.0.0。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
受体文件。 ligand TargetOptLigand object 配体文件。 md_params MdParam object MD参数配置。 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称，取值范围：[1,
导入流程 功能介绍 导入流程 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/workflows/import 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
"xxxxxxxx" //替换为实际的project name，如cn-north-4 } } } } 获取Token后，再调用其他接口时，您需要在请求消息头中添加“X-Auth-Token”，其值即为Token。例如Token值为“ABCDEFJ....”，
解决方案 避免启动作业后立即取消。 克隆作业即可。 process使用errorStrategy 'ignore'时整个作业不会结束 问题现象 process中使用了errorStrategy 'ignore'，当该process因为某种原因失败后，整个作业的状态一直处于运行中。
ligand 否 TargetOptLigand object 配体文件。 md_params 否 MdParam object MD参数配置。 表4 CreateDrugJobBasicInfo 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 作业的名称，取值范围：[5
合物发现，先导化合物优化全流程药研所需功能。同时基于云原生的软硬件一体化加速，大大提升虚拟筛选和分子动力学模拟计算效率。 全平台无需软硬件安装调试成本，开箱即用，随时可用。全平台包括盘古辅助制药赋能药物研发的全链条任务，将新药研发从“马拉松”迈向“加速跑”。 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
镜像管理 镜像管理简介 导入或上传镜像 安装容器引擎 获取镜像 制作Docker镜像 上传镜像到SWR镜像仓库 发布镜像 父主题： 用户指南（基因平台）
更新镜像描述信息或者类型 功能介绍 更新镜像描述信息或者类型 调试 您可以在API Explorer中调试该接口，支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例，并提供SDK代码示例调试功能。 URI PUT /v1/{project_id}/eihealt
Nextflow 简介 安装/卸载Nextflow 新建流程 管理流程 新建作业 管理作业 约束限制 作业执行失败排查思路 父主题： 用户指南（基因平台）
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
在“工具”页面左侧，单击图标新建分类标签。 在添加分类标签弹窗中，输入“名称”，勾选需要呈现的标签名称。最多可以勾选5个标签。 图1 添加分类标签 勾选完成后单击“确定”。 页面自动筛选出带有所选标签的应用或流程。 图2 添加完成 父主题： 工具管理
保留期与欠费 套餐包到期后，如果账号欠费，会根据“客户等级”和“订购方式”定义不同的保留期时长，保留期内您将不能进行资源访问，保留期内资源处理和费用详见“保留期”。保留期满仍未续订或充值，数据将被删除且无法恢复。 当平台处于冻结状态，且资源不再使用，您可以进入EIHealth控制
Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题： 用户指南（基因平台）
查询作业详情 使用get命令查询作业的详细信息，该命令同时可以用于获取作业模板。 命令结构 health get job ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 否 不选此参数时，列出当前所在项目的所有作业信息。 指定job-id时，列出具体作
数a设置了2个参数值，给参数b设置了2个参数值。那么，系统将自动生成4个作业并发执行。 方式二：参考批量执行NGS分析操作。 参数确认无误后，单击“立即创建”，创建应用。 表1 fastp、bwa_samtools应用参数说明 应用名称和版本 应用名称：fastp 版本：0.20
创建镜像 功能介绍 创建镜像 调试 您可以在API Explorer中调试该接口，支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例，并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eih
导致受体展示不完整。可通过手动删除文件中REMARK行来解决该问题。 如下所示： 分子优化靶点设置界面，受体展示正常。 但是下载该靶点文件后，使用通用工具Mol 3D Viewer打开，会出现蛋白显示不完整的情况，如下图所示。 此时可将受体文件中的REMARK行进行删除，即可解决该问题。
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