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表6 ReceptorDrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。
缺省值:false 表5 ReceptorDrugFileReq 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。
最小长度:1 最大长度:10240 表5 CpiReceptor 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。
表6 DrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。
提供了数据库的创建、查询和管理能力。 支持药物虚拟筛选能力。 命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。
本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果(https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821),并搭建虚拟药物筛选数据库。 图1 药物筛选之旅 父主题: 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选
支持十亿节点、百亿边的超大规模图数据库查询,提供适用于基因和生物网络数据的图深度学习算法。 拥有基于基因组数据自动深度学习的技术框架AutoGenome,深度融合人工智能技术,产生更加便捷、快速、准确、可解释的医疗智能模型,加速医疗大健康行业的研究工作。
最小长度:1 最大长度:10240 表5 ClusteringDrugFile 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。
自动作业管理 启动、停止、创建、更新、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ Nextflow 启动、停止、重试、创建、更新、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 开发环境 创建、导入 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 启、停 √ √ √ - - 数据库
DATABASE_IMPORT 导入数据库。导入数据时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 JOB_STATUS 作业状态。作业的状态发生跳变时给予消息提示。 MESSAGE_CLEAN 消息清理。消息中心的消息总和超过设置值时,进行消息清理。
图4 引用的数据 引用OBS类型数据时,如果数据在OBS中的存储类型为“归档存储”,则将该数据引用过来后,该数据不能用于创建分析作业、数据库导入数据,并不可下载、归档。
该流程主要基于Kraken2构建,跟进数据库进行物种注释。 RNA Cufflinks transcriptome analysis process 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。
RUN 用来修改镜像的命令,常用来安装库、程序以及配置程序。一条RUN指令执行完毕后,会在当前镜像上创建一个新的镜像层,接下来的指令会在新的镜像上继续执行。 RUN 语句具有以下形式。 RUN yum update:在/bin/sh路径中执行的指令命令。
自动作业的名称 description String 自动作业的描述 status String 自动作业状态 create_time String 自动作业创建时间 finish_time String 自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID