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描述 type String 任务启动事件类型 count Integer 任务启动事件发生次数 reason String 任务启动事件状态 message String 任务启动事件详细信息 first_timestamp String 任务启动事件首次上报时间 last_timestamp
Integer 作业启动事件发生次数 first_timestamp String 作业启动事件首次上报时间 last_timestamp String 作业启动事件末次上报时间 message String 作业启动事件详细信息 reason String 作业启动事件状态 type
com ... CMD 用来设置启动容器时默认运行的命令。 ENTRYPOINT 用来指定容器启动时的默认运行的命令,与CMD类似。区别在于:运行容器时添加在镜像之后的参数,对ENTRYPOINT是拼接,CMD是覆盖。 若在DockerFile中指定了容器启动时的默认运行命令为ls -l,则运行容器时默认启动命令为ls
[flags] # edit和update作用相同 health update app ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 可选: 应用的ID(app-id),使用命令行工具创建应用时生成。示例请参见创建应用命令示例。 应用的名称、版本
-s命令获取启动分析作业的模板。依据模板要求,将步骤3中获取到的NGS作业信息和workflow-id填充至模板中,修改好的配置文件示例请参见NGS配置文件示例。 请将该模板保存为.yaml格式至本地,并在本地完成模板修改。例如,命名为ngs.yaml。 编写执行脚本并提交作业
描述 type String 任务启动事件类型 count Integer 任务启动事件发生次数 reason String 任务启动事件状态 message String 任务启动事件详细信息 first_timestamp String 任务启动事件首次上报时间 last_timestamp
描述 type String 任务启动事件类型 count Integer 任务启动事件发生次数 reason String 任务启动事件状态 message String 任务启动事件详细信息 first_timestamp String 任务启动事件首次上报时间 last_timestamp
apt-get install -y openbabel Dockerfile中不可以指定CMD以及ENTRYPOINT,否则会覆盖基础镜像启动脚本,引起异常。 按键盘Esc键,并执行:wq保存退出Dockerfile。 执行docker build -t image:tag .命令,自动完成镜像制作。
基础操作系统类镜像,如Ubuntu、Suse、Centos等。 基础编程语言类镜像,如Java、Python、R语言等。 基础通用类软件镜像,如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。
建议设置Docker镜像开机启动,防止出现“docker: Cannot connect to the Docker daemon at unix:///var/run/docker.sock. Is the docker daemon running?”报错。 设置Docker开机启动命令:systemctl
靶点文件:支持PDB格式文件,文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体,默认只处理第一个。 靶点预处理: 去配体:提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷:是否加入离子,使体系电荷守恒,默认是平衡电荷。 蛋白力场:蛋白质力场支持amber03, amber94, amber96, amber99
校验token 功能介绍 校验token是否可访问当前环境 URI GET /v1/{project_id}/users/token-verification 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
取值范围:输入字符最大长度为255 最大长度:255 database_id 是 String 自动作业依赖的数据库ID 最小长度:1 最大长度:128 database_column 是 String 自动作业状态更新列 最小长度:1 最大长度:55 database_column_type 否 String
stqc。 pull镜像。 若该镜像没有lastest版本则需进入dockerhub官网进行查询。 查看镜像是否pull成功。 用docker images命令查看镜像是否pull成功。如果您本地已经有很多镜像,防止查询出全部镜像,可在docker images命令后面添加 | grep
为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 schedulable 是 Boolean 是否可调度 响应参数 无 请求示例 设置是否可调度,设置为可调度 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
权限,不同类型成员所拥有的权限请参见成员角色和权限。 冻结:冻结项目。一个项目可能由于某些原因暂时中止,此时可以将项目暂时冻结,待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目,用户无法进入该项目查看项目的开发环境、流程等历史运行情况,当前正在运行的分析作业会继续执行直到完成。冻结的项目可以通过“解冻”操作重新激活。
范围:1-100。 冷却时间 冷却时间需设置三部分。 扩容执行后多久能再次判断是否缩容。取值范围:5-10080。 节点删除后多久能再次判断是否缩容。取值范围:1-10080。 缩容失败后多久能再次判断是否缩容。取值范围:1-10080。 缩容并发数 最多支持多少个空闲节点同时缩容。取值范围:1-50。
值:根据参数类型,填写或者选择相关取值。 必传:参数是否必传,此参数为非必填项。如果开启“必传”,则“值”为必填项。 描述:参数描述,此参数为非必填项。 操作:可以单击操作列“删除”,删除对应的参数。 图2 配置流程参数 参数配置完成后,单击“保存”。 流程创建成功后,单击“保存并启动作业”,或者在流程管理页
jupyter形式的代码示例。 example_with_user_modify.py 与example.ipynb内容基本相同,为python脚本形式示例。 配置eihealth-toolkit(见example.ipynb中配置提示,需要添加config以及切换到当前目录)。 初始化配置请参考步骤3:初始化配置章节。
命令结构 health edit compute-resources [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 --force -f 否 是否强制操作。 --labels -l 否 需要添加或删除的标签列表。json数组格式。如:-l "[\"h1\",\"h2\"]"