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创建数据库模板 使用create命令创建数据库模板。 命令结构 health create database template <template-name> [flags] 或者 health create db template <template-name> [flags]
platform-id信息,获取方法请参见获取认证信息。 health config add [flags] 表2 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --domain-name -d 是 与管理员(购买平台的账户)的账号名一致。 --user-name -u 是 子用户的用户名。
参数描述。取值范围:[0-255] 最小长度:0 最大长度:255 required 是 Boolean 参数是否必须 concurrent 否 String 参数是否开启并发。当前支持vars_iter并发类型,不填表示未开启并发。 最小长度:0 最大长度:16 type 是 String
参数描述。取值范围:[0-255] 最小长度:0 最大长度:255 required 是 Boolean 参数是否必须 concurrent 否 String 参数是否开启并发。当前支持vars_iter并发类型,不填表示未开启并发。 最小长度:0 最大长度:16 type 是 String
true # 参数是否必须,取值[true,false] concurrent: vars_iter # 是否并发,取值 vars_iter 时为开启并发状态,不设置则不开启
Nextflow作业管理命令 启动作业 查询作业 删除指定作业 重试作业 停止作业 获取任务信息
notebook命令 创建notebook 获取notebook信息 删除notebook 编辑notebook 启动notebook 停止notebook
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错
EIHealth作业管理命令 作业配置文件说明 启动作业 查询作业详情 删除指定作业 重试作业 取消作业 导出作业 获取任务实例
gz和xxx.R2.fastq.gz。 步骤3:创建分析作业 单击项目名称,进入“项目管理”页面,并选择“工具”页签。 单击ngs“操作”列“启动作业”,在弹出的新建作业页面,填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”,设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。
自动作业管理 获取自动作业模板列表 创建自动作业模板 删除自动作业模板 更新自动作业模板 查询自动作业模板 启动自动作业 停止自动作业 父主题: 应用管理
数据管理。 步骤3:创建分析作业 单击项目名称,进入“项目管理”页面,并选择“工具”页签。 单击Docking Summary“操作”列“启动作业”,在弹出的新建作业页面,填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”,设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。
计算资源扩缩容 创建扩容策略 查询扩容策略列表 获取扩容策略详情 修改扩容策略 删除扩容策略 获取策略关联计算资源列表 获取策略伸缩历史 获取策略事件 启动自动扩容策略 停用自动扩容策略 修改缩容策略 查询缩容策略 父主题: 系统管理
本。 依据FastQC命令说明填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量,并以大括号扩起,以$符号进行引用。 fastqc软件输入参数填写为input-file、threads,输出参数为output-dir,则镜像启动命令如下所示。 使用-t命令,指定运行所
测试模式运行,不执行实际的下载操作。 --vlength -v 否 下载完成后,验证本地文件大小是否与桶中对象的大小一致。 --vmd5 -M 否 下载完成后,验证本地文件的MD5值是否与桶中对象的MD5值一致。 桶中对象必须包含元数据x-obs-md5chksum,否则会忽略MD5值校验。
计算资源管理 购买计算资源 查询计算资源 删除计算资源 获取节点剩余配额 查询计算资源规格 关闭计算资源 重启计算资源 启动计算资源 修改计算资源调度信息 查询计算资源调度信息 查询bms计算资源显卡id列表 获取EVS配额及使用情况 父主题: 系统管理
true # 参数是否必须,取值[true,false] concurrent: vars_iter # 是否并发,取值 vars_iter 时为开启并发状态,不设置则不开启
数据归档、数据管理等相关操作API。 数据库管理 数据库管理 数据库管理、模板管理等相关操作API。 应用管理 应用管理 导入应用、创建应用、获取应用详情、删除应用等相关操作API。 流程管理 流程管理 导入流程、创建流程、获取流程详情、删除流程等相关操作API。 作业管理 作业管理 启动作业、获取作业详情、停止作业等相关操作API。
本。 依据FastQC命令说明填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量,并以大括号扩起,以$符号进行引用。 fastqc软件输入参数填写为input-file、threads,输出参数为output-dir,则镜像启动命令如下所示。 使用-t命令,指定运行所
le为false。 --vlength -v 否 同步上传完成后,验证上传到桶中对象的大小是否与本地文件大小一致。 --vmd5 -M 否 同步上传完成后,验证上传到桶中对象的MD5值是否与本地文件的MD5值一致。 如果待上传的本地文件较大,使用该参数将会因为计算MD5而导致整体