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将下载的OpenMPI压缩包(以openmpi-3.1.1.tar.gz为例)拷贝至弹性云服务器内,并执行以下命令进行解压。 # tar -xzvf openmpi-3.1.1.tar.gz # cd openmpi-3.1.1 执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install binutils-devel
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
修改Makefile文件01 图2 修改Makefile文件02 执行以下命令,编译lammps,并将当前目录生成的lmp_mpi文件拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。设置每迭代10
使用私有镜像创建的弹性云服务器创建成功后,您可以在弹性云服务器列表页查看详情,这些云服务器将被用作HPC集群。 API方式 以创建H2型ECS集群为例: URI POST /v1/{$tenant_id}/cloudservers 请求样例 假设需要批量创建4台弹性云服务器,则修改count值为4,请求样例如下:
依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤1.1~步骤1.3,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看ECS的主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤2.1~步骤2.2,获取所有ECS的主机名。
localhost $ ssh hostname1 依次登录集群中其他ECS,重复执行步骤1~4。 执行以下命令,验证参加测试的ECS之间是否可以免密码互相登录。 假设集群中有2个弹性云服务器,另一个云服务器的主机名为hostname2,则命令行为: $ ssh 用户名@SERVER_IP $ ssh
依次登录集群中所有ECS,重复执行1.a~1.c,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行2.a~2.b,获取所有ECS的主机名。 登录集群中任意一台ECS。
进入弹性云服务器信息页面。 在弹性云服务器列表页,选择待制作镜像的云服务器,确认云服务器为“关机”状态。 如果云服务器为“开机”状态,您可通过单击“操作”列下的“更多 > 关机”将云服务器关机。 单击“操作”列下的“更多 > 制作镜像”,将弹性云服务器制作为私有镜像。 根据界面提示,填写镜像的基本信息。
使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令,关闭弹性云服务器的防火墙。 #
器作为Server端,A机器作为Client端,dtest/rping测试RoCE网络仍异常。 解决方案: 1.请检查集群中每个节点的配置文件/etc/dat.conf中"ofa-v2-cma-roe-enp177s0"是否放在首行且每个节点都一致。 2.若以上方法无法解决,请联系技术支持处理。
安装和使用MPI 弹性云服务器场景支持使用的MPI IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
执行下列命令,导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。
执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 执行以下命令,生成可执行文件。
拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id root@192.168.0.166 配置ssh第一次登录免输入yes 在~/.ssh/config文件中加入如下内容: StrictHostKeyChecking
如果存在多个pkey,使用英文逗号隔开。 执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 检查环境变量 在单个BMS上运行Platform MPI。 执行以下命令,重新编译hello.c文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Platform
c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。 # vi
c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。 # vi
me/rhel”目录下)。 执行以下命令,解压软件包。 # tar -xzvf openmpi-3.1.0.tar.gz # cd openmpi-3.1.0 执行以下命令,安装所需要的库文件,安装之前请确保BMS能与外网连通。 执行以下命令,安装依赖包。 # yum install
c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。 # vi
MPI_REMSH 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图1 检查MPI环境变量 在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 假设hello.c文件在“/home/rhel/”目录下,生成的可执行文件名为hello,执行以下命令: $ cd /home/rhel/