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支持3种输入方式，分别是输入氨基酸序列、选择文件、输入PDB ID 输入FASTA格式氨基酸序列，输入框最多支持输入100条氨基酸序列，每条氨基酸序列最多支持输入2048个字符。 图1 靶点配置输入氨基酸序列 选择文件，支持fasta格式和pdb文件。 fasta格式文件，最多上传1个文件，文件中最多支持100条氨
药物数据输入格式说明 药物虚拟筛选平台的输入数据，需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求，将数据上传至项目中。 输入蛋白质，pdb格式，将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子，配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串，第二列为smiles名称，中间用tab键分割。
钥）。 区域（Region） 从地理位置和网络时延维度划分，同一个Region内共享弹性计算、块存储、对象存储、VPC网络、弹性公网IP、镜像等公共服务。Region分为通用Region和专属Region，通用Region指面向公共租户提供通用云服务的Region；专属Regio
app_summary String 应用简述 app_description String 应用描述 app_image String 应用镜像 app_commands Array of strings 任务使用到的应用自带的命令信息 app_input_parameters Array
在新建作业页面，填写作业信息。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。 不填写路径时，默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级：运行优先级，分为0~9级，优先级高的作业会被优先执行（该特性规划中，暂未上线）。
app_summary String 应用简述 app_description String 应用描述 app_image String 应用镜像 app_commands Array of strings 任务使用到的应用自带的命令信息 app_input_parameters Array
app_summary String 应用简述 app_description String 应用描述 app_image String 应用镜像 app_commands Array of strings 任务使用到的应用自带的命令信息 app_input_parameters Array
该参数用于获取任务实例事件列表。不带该参数，默认输出任务实例详情（默认json格式）。 --file-path -p 否 获取任务实例详情时，设置任务实例详情下载路径。 --yaml -y 否 获取任务实例详情时，以yaml格式输出任务实例详情（默认json格式）。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
导出多个job-id时，用分号（;）隔开。 格式：id1;id2;id3。 --file -f 否 要导出的id列表文件，使用job-id文件导出作业时必选。 job-id-file 无 否 要导出的id列表的文件位置。 文件内容格式：{"ids":"id1;id2;id3"}。
创建数据库 导入数据 数据库创建好以后，您可以参照数据库模板格式，将已有的数据进行导入。 单击数据库右上角“导入数据”。 图3 选择导入数据 选择需要导入的数据文件。 请选择*.csv , *.txt, *.vcf格式文件，当前仅支持utf-8编码。 导入数据列与模板保持一致，无需考虑自动作业新建的作业状态更新列。
根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 单分子文件格式转换 创建分子或分子复合物批量下载任务 查询分子或分子复合物批量下载任务详情 受体预处理（Fasta格式） 单分子预对接 父主题： API（盘古辅助制药平台）
-b 否 列举结果中字节数的显示格式。取值范围[human-readable, raw]。 如果未设置该参数，则列举结果中字节数的显示格式由配置文件中的humanReadableFormat参数决定。 --format -F 否 指定以自定义格式打印列举结果。当前仅支持值[default]，指定列举结果在一行显示。
数据库模板：使用资产市场订阅的流程时，模板已预置，无需选择数据库模板。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking Summary”流程时，保存格式为.txt。 相对路径：流程运行完成后，会按照流程子任务的名称生成数据文件，
trimmomatic 使用trimmomatic工具去掉测序接头，得到去接头后fastq格式的reads。 star 使用STAR比对工具将去接头后的reads比对到参考基因组，得到bam文件和多种格式的统计报告。 使用RNA-Seq流程的详细步骤如下所示： 步骤1：订阅流程 步骤2：上传待分析数据
0::gwj-test-01' # 应用id，取值范围[1,135]，正则先不能有中文，两种格式。特殊id，采用{app_name}::{app_version}::{src_project_name}格式，用于手动创建场景；
配体分子：配体分子文件，支持SMILES、3D SDF、PDB、MOL2格式。 受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、
或合成路径规划或自由能微扰后，单击“确定”即可创建下游分析。 单击“下载3D”可以下载小分子或复合物，小分子支持SDF和PDB格式，复合物只支持PDB格式。 单击“查看详情”可以直观查看小分子的结合能和属性信息。 图11 查看详情 单击按钮，可以收藏对接结果，收藏后可直接在收藏夹页查看。
靶点优化基于分子动力学模拟和结构聚类，实现靶点结构优化 单击“靶点优化”功能卡片，进入配置页面。 配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件：支持PDB格式文件，文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体，默认只处理第一个。 靶点预处理： 去配体：提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷
聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件；文件大小不超过5G；小分子支持10-10,000个，超出10,000的分子会进行截断。 输入小分子：可以通过上传文件或输入SMILES以输入小分子。
修改列名和对应的值，用反单引号引用列名和值，格式为`column-name1:value1`;`column-name2:value2`，更新或插入多个列值时使用分号。 说明： 对于极其特殊的值，例如：qqq'\"`22，qqq'\"`22，aa`;`aaa:4444`，因为与上述要求的格式冲突，暂时不支持操作。
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