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流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算，如何解决偶现报错
项目管理 收藏管理 镜像管理 标签页面管理 项目审计管理 虚拟药物筛选 父主题： API（医疗智能体平台）
project时，默认为当前项目。例如GATK:4.0:projectname。 --sample -s 否 获取应用模板，模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取应用详情时，将内容下载到的指定文件夹路径（文件夹需要存在）。 --project 无 否
数据的分析。 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成，各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
开发环境（Notebook） Notebook简介 创建Notebook Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题： 用户指南（基因平台）
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
NotebookToolDto 参数 参数类型 描述 display_name String 显示名称 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 请求示例 获取notebook工作环境 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
您可以使用该工具创建、获取、删除和导入数据库模板，创建、获取和删除数据库实例，也可以引用数据库。 镜像管理 您可以使用该工具对镜像执行标记、上传、下载、查询、导入、更新和删除标签等操作。 应用管理 应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 您可以使用该工具创建应用，并进行修改、删除、查询、导入操作。
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台
受体预处理（Fasta格式） 功能介绍 受体预处理（Fasta格式），用于前端计算预期扣费次数 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/fasta-preprocess
系统级别用户管理 系统级的角色配置，可创建平台的子用户，并为其分配权限。 项目级别用户管理 资源级的角色配置，以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组，以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。详细介绍请参见项目管理，项目级用户不同角色对应的权限请参考成员角色和权限。 图1 系统级别用户管理
配体格式转换为SMILES 功能介绍 配体格式转换为SMILES，若配体文件中存在多个分子，则只取第一个返回。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles
的结果或者分子3D构象。如果分子设置了靶点，可以下载小分子或复合物，若分子未设置靶点，只能下载小分子。小分子支持SDF和PDB格式，复合物只支持PDB格式。 单击可以收藏结果，收藏后可直接在收藏夹页查看。 分子优化对应的下游分析为分子优化、分子搜索和合成路径规划，如果分子设置了靶
应用短描述 description String 应用描述 labels Array of strings 应用标签 image String 应用镜像 commands Array of strings 应用命令 resources ResourceDto object 应用申请资源 inputs
配模式后才会执行该匹配模式。 使用“time1-time2”，代表匹配的时间段，其中time1必须小于等于time2，格式为yyyyMMddHHmmss。时间格式支持自动补全，例如yyyyMMdd等价于yyyyMMdd000000，yyyyMM等价于yyyyMM01000000。
在配置页面，可以在左侧绘制分子，也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。 最大搜索路径个数：合成路径规划的路径数量。路径数量增加，将展示更多的合理合成路径；路径数量减少，可能会有部分合理路径未展示。默认值50，取值范围1-50。
的结果或者分子3D构象。如果分子设置了靶点，可以下载小分子或复合物，若分子未设置靶点，只能下载小分子。小分子支持SDF和PDB格式，复合物只支持PDB格式。 分子生成对应的下游分析为分子搜索、分子优化和合成路径规划，如果分子设置了靶点，可以选择自由能微扰进行下游分析，通过单击“下游分析”可以进行创建。
空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 最小长度：1 最大长度：32 数组长度：0 - 5 image 是 String docker镜像地址 取值范围[5-255]，不能包含中文字符 最小长度：5 最大长度：255 commands 是 Array of strings
空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 最小长度：1 最大长度：32 数组长度：0 - 5 image 是 String docker镜像地址 取值范围[5-255]，不能包含中文字符 最小长度：5 最大长度：255 commands 是 Array of strings
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