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细可参考存储类别。 规格 套餐包支持的购买规格。 购买数量 购买套餐包的数量。取值范围:1-50。 购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月,最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。 如果支付时间晚于指定生效时间,资源包将在支付后立即生效。
运行作业 方式1:使用预置的NGS流程 方式2:使用预置应用搭建NGS流程 方式3:自定义镜像运行FastQC流程
使用合规数据 您添加的数据属于您的内容,您应对您的内容的合法合规性负责,建议您根据对您可适用的法律法规,进行相应的脱敏、匿名、加密或其他符合要求的处理或采取相应保护措施,当您在复制或者引用数据的时候,需审视是否存在隐私数据,请谨慎操作。 上传数据方式 在开始执行分析作业前,请
使用合规数据 您添加的数据属于您的内容,您应对您的内容的合法合规性负责,建议您根据对您可适用的法律法规,进行相应的脱敏、匿名、加密或其他符合要求的处理或采取相应保护措施,当您在复制或者引用数据的时候,需审视是否存在隐私数据,请谨慎操作。 上传数据方式 在开始执行分析作业前,请
(NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时,大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序和表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对等步骤,输出针对fastq的qc报告,输出STAR比对得到的bam文件。
ct,列出具体应用的信息,srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --sample -s 否 获取流程模板,模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取workflow详情时,将内容下载到的指定文件夹路径(文件夹需要存在)。
计费 平台计费方式 保留期与欠费 话单延迟导致欠费 不同类型的归档,费用分别是多少
热点对象应用场景。 规格 套餐包支持的购买规格。 购买数量 购买套餐包的数量。取值范围:1-50。 购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月,最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。 如果支付时间晚于指定生效时间,资源包将在支付后立即生效。
作业配置文件说明 流程创建完成后,可基于已创建的流程运行分析作业。 在EIHealth平台,运行分析作业的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于已获取到的模板使用命令行工具启动分析作业,运行的分析作业将同步显示到EIHealth平台。 获取作业模板
单击“提交”,可在作业中心查看该作业的运行情况。 查看运行结果。 输出每对配体的相对结合自由能、分子图、相似性等。也可以单击右边“查看轨迹”,下载运动轨迹。结果页面支持Pair和Ligand两种查看方式。 Ligand查看方式下,可对结果进行收藏,在Ligand中的收藏同步3D视图。如果取消
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 FormData参数
新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 新型冠状病毒(COVID-19)的出现在全球范围影响了人类健康,寻找有效治愈新冠肺炎的治疗方式是临床医生和药物研发人员最紧迫的工作。 为了全面、系统地评估药物对新冠病毒所有靶点蛋白的结合情况,华为云EI医疗智能体团队与华中科技大学同济医学院基础医学
获取应用详情时,将内容下载到的指定文件夹路径(文件夹需要存在)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索应用。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux
为当前项目。例如ngs:1.0:srcproject。 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。 --summary -s 否 流程的简要描述。 --description -d 否 流程的详细描述。 --output_dir -o 否 输出路径。不指定时,以当前项目的根目录为工作路径。
上传流程 通过在本地修改流程的yaml模板,上传流程至项目中。 获取流程yaml模板。 单击“上传流程”,在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具,执行health get workflow -s命令获取创建流程的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或
1个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化,获取靶点蛋白的3D结构。对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估,同时从21个蛋白的角度,综合、无偏的评估药物效果,从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 父主题: EIHealth平台
项目简介 项目是EIHealth平台的一个工作空间,可以在项目中存储数据,上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中,并通过设置成员角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。您可以创建项
单击“查看详情”可以直观查看小分子的结合能和属性信息。 图11 查看详情 单击按钮,可以收藏对接结果,收藏后可直接在收藏夹页查看。 分子对接结果支持以卡片视图的形式进行查看,参考图12,在卡片视图中: 图12 查看输出结果(3) 单击右上方的选择下拉框,可以选择分子的排序方式,将分子按照所选的排序方式进行展示。
参数说明 参数 简写 是否必选 说明 obj 不涉及 是 查看的文件、文件夹对象。 注意: 如果为引用数据,必须要使用绝对路径(文件夹最后要加/)。未引用的数据不能查看。 --bf -b 附加参数,可选 设置是否以人方便阅读方式输出结果。取值包括:human-readable、raw。
引用数据可以引用其他项目中或对应的obs桶的数据。引用的数据不能在该项目中进行更改。只能用来运行作业,导入数据到数据库等操作。 图3 引用数据 URL导入数据 以URL导入的方式添加数据类似于linux中的wget操作。单击“添加URL”按钮可以添加具体的链接,最多可添加10条链接。