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方式1：使用预置的NGS流程 使用EIHealth平台预置的流程进行运行作业。 步骤1：订阅流程 进入资产市场订阅已有的流程，以二代基因测序数据的变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2：订阅数据 若您
平台计费方式 基因平台 基因平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需
登录平台方式 管理员（购买平台的账户） 登录医疗智能体管理控制台。 选择账号登录，填写账号名和密码，登录平台。 图1 登录界面 子用户（子管理员、操作员） 登录医疗智能体管理控制台。 选择IAM用户登录，填写账号名、IAM用户名、密码，登录平台。 账号名：与管理员（购买平台的账户）的账号名一致。
由于生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。 将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理，实现高效的调用，极大方便了软件的安装和运行。
不同类型的归档，费用分别是多少 选择归档存储类别涉及以下三种计费： 归档类别数据的存储费用 恢复归档数据的流量费用 提前删除归档数据（不满90天）收取的费用 存储类型 存储空间（按需） 存储套餐包（1TB 1年） 数据取回（直读） 数据取回（加急/标准） 删除对象 标准存储 0.0990元/GB/月
的使用，不用担心复杂的开发环境问题。 流程是由1各或者N个应用串联构建而成，平台页面以简单拖拽、连接的方式将不同的应用连接起来构建成一个分析流程，避免了写繁杂的bash脚本。 步骤1：订阅应用 进入资产市场，分别订阅fasp，bwa-mem，bamqc，picard-insertsize应用。
导入数据库模板 导入模板 提供两种模板导入方式： 平台支持导入其他项目的模板，用户需是其他项目中的成员，且为其他项目的“所有者”或“管理员”，预置的模板不支持导入。 在左侧导航栏选择“模板”页签，单击“导入模板”。 导入方式选择“项目”，选择项目名称，勾选需要导入的模板，可以在“导入模板名称”中修改模板名称，单击“确定”。
程所需的应用。 图2 填充应用内容 对于测序得到的大量数据，如果需要批量执行NGS分析，可以选取以下任意一种方式进行批量执行： 方式一：对于输入参数，打开“并发”开关，在启动作业时，每个参数可以设置多个参数值，自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。
靶点口袋分子设计结果支持以卡片视图的形式进行查看，参考图5，在卡片视图中： 单击可以收藏结果，收藏后可直接在收藏夹页查看。 单击右上方的选择下拉框，可以选择分子的排序方式，将分子按照所选的排序方式进行展示。 图2 排序方式 单击右上方的筛选，可以进行属性和相互作用力筛选。 图3
基因平台 基因平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需计费，计费详情请参考OBS流量费用中“公网流出流量
Nextflow需要用户自己进行安装，安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。 GitHub获取：可以选择版本，目前支持选择的安装包版本v22
取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig，根据contig下发对应的任务，并依据不同任务，指定并行下发的任务数，以降低流程整体的运行时间。 流程执行信息 NGS流程由fastp、bwa-mem、
执行数据管理类操作需要项目成员具备相应的权限，详细的权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称，不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符，将不支持下载，可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、数据删除等操作均为系统的异步任务，您可以在“数据作业”中查看任务的执行状态。同时，平台针对该类任务支持您在“数据中心
创建作业 创建作业有以下几种不同的方式，您可以任选其中一种方式。 通过功能模块创建 通过作业中心页面创建 •新建作业 •克隆作业 通过“功能模块”创建 在“功能模块”页面，选择对应的模块，单击“立即使用”。 在具体的功能模块页面，配置相关参数信息。具体参考功能模块章节。 通过“作业中心”页面创建
优先级：运行优先级，分为0~9级，优先级高的作业会被优先执行。默认值为0。 如果当前投递的IO加速的作业，超过sfs总的作业配额数， 那么超出部分的作业会按照投递时间顺序，从最新投递的向前执行，不会按照优先级进行运行。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节
执行数据管理类操作需要项目成员具备相应的权限，详细的权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称，不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符，将不支持下载，可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据拷贝、数据删除、数据下载、数据归档、恢复数据等操作均为系统的异步任务，您可以在“消
制作Docker镜像，有以下两种方法。 快照方式制作镜像（偶尔制作的镜像）：在基础镜像上，比如Ubuntu，先登录镜像系统并安装Docker软件，然后整体制作快照，即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像（经常更新的镜像）：将软件安装的流程写成DockerFile，使用Docker
制作Docker镜像，有以下两种方法。 快照方式制作镜像（偶尔制作的镜像）：在基础镜像上，比如Ubuntu，先登录镜像系统并安装Docker软件，然后整体制作快照，即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像（经常更新的镜像）：将软件安装的流程写成DockerFile，使用Docker
--skip-lines -s 否 跳过的header行数。不指定参数值时默认为0。 --delimiter -e 否 常用的三种分隔符为（;,\t），也可以根据导入数据的文件格式设定其他分隔符。 --files -f 否 生成实例数据的文件列表，多个文件用分号(;)分隔。 --project
设置邮箱消息的接收范围和接收类型。 接收范围 仅自己接收操作：自己所执行的操作。如果选择此项，接收类型默认全选。 全部接收：自己有权限访问的项目中产生的操作，包含自己和其他项目成员所执行的操作。默认为全部接收。 不接收：不接收操作通知。 接收类型 数据操作：数据的复制、删除、导入等异步操作通知。
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