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LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich-332/lib 执行下列命令，导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令，查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示，表示环境变量导入成功。 执行以下命令，在单个BMS上运行MPICH。
执行以下命令，添加本主机私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 示例： 192.168.0.1 ecs-ff-0001 执行以下命令，ssh方式登录本节点，验证是否可以不输入密码登录ECS。 假设本主机的主机名为hostname1，则命令行如下： $ ssh localhost $ ssh hostname1
tel/impi/2018.0.128/lib64 执行下列命令，导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令，查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 Intel MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示，表示环境变量导入成功。 执行以下命令，在单个BMS上运行Intel
MPI_IB_PKEY=步骤2.1中获取的pkey $source ~/.bashrc 如果存在多个pkey，使用英文逗号隔开。 执行以下命令，检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 Platform MPI环境变量导入成功 执行下列命令，在单个ECS上运行Platform
登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令，查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行步骤1.2～步骤1
登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令，查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行步骤1.2～步骤1
MPI_IB_PKEY=2.a中获取的pkey $source ~/.bashrc 如果存在多个pkey，使用英文逗号隔开。 执行以下命令，检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 检查环境变量 在单个BMS上运行Platform MPI。 执行以下命令，重新编译hello
登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令，查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行1.b～1.c，关闭所有BMS的防火墙。
nmpi-310/lib 执行以下命令，导入配置的MPI环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行以下命令，查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令，在单个BMS上运行社区OpenMPI。
登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令，查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行1.b～1.c，关闭所有BMS的防火墙。
登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令，查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行1.b～1.c，关闭所有BMS的防火墙。
登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令，关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令，查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS，重复执行1.b～1.c，关闭所有BMS的防火墙。
登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令，防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令，验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令，关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F # service
登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令，关闭ECS防火墙。 # systemctl stop firewalld.service 执行以下命令，查看防火墙是否关闭成功。 # systemctl status firewalld.service 图1 成功关闭防火墙 依次登录集群中所有ECS，重复执行1
登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令，关闭ECS防火墙。 # systemctl stop firewalld.service 执行以下命令，查看防火墙是否关闭成功。 # systemctl status firewalld.service 图1 关闭防火墙成功 依次登录集群中所有ECS，重复执行步骤1
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的，例如LAMMPS， GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持，如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例，介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令，安装FFTW软件。
dUc9MClnv 说明： 样例密码随机生成，请勿复制使用样例。 选择“购买时长”。 计费模式为“包年/包月”类型，需同时选择购买时长，同时用户可选择是否需要“自动续费”，如勾选了“自动续费”，包周期到期后会自动续费。 选择“节点数量”。 集群原有的计算节点和新扩容的计算节点总计不超过50个。
export MANPATH=$MPI_ROOT/share/man:$MANPATH unset MPI_REMSH 执行以下命令，查看环境变量导入是否成功。 # which mpirun 图3 查看环境变量 执行以下命令，在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 执行以下命令，编辑文件。
登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令，防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令，验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令，关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F # service
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